女性生殖器结核因多数病人缺乏明显症状，阳性体征又不多，故诊断有时存在困难。为提高确诊率，必须详细询问病史，并借助一些辅助诊断方法，以明确诊断。
辅助诊断方法有以下几种：①子宫内膜病理检查：是诊断子宫内膜结核最可靠的依据。可于经前1周或月经来潮12小时内作诊断性刮宫术，刮宫时应注意刮取子宫角部的内膜，并将刮出物全部送病理检查，刮宫前后应使用抗结核药物以防止结核病灶扩散。在病理切片上如找到典型的结核结节，诊断即可成立。但病理检查阴性时，也不能完全排除结核的可能。遇有子宫腔小而坚硬，无组织物刮出，结合病史及症状也应考虑内膜结核，应做进一步检查和观察。如子宫颈或阴道有结核可疑，可作活组织切片检查，以明确诊断。②X线检查：胸部X线透视，必要时作胃肠或泌尿系统X线检查以便发现原发病灶；盆腔X线平片检查，如存在孤立的钙化点，则表示盆腔有结核病灶存在。生殖器结核时行子宫输卵管碘油造影，可见下列特征性变化：子宫腔呈重度狭窄或畸形，边缘呈锯齿状；输卵管腔可有多个狭窄部分，呈典型的串珠状或显示管腔细小而僵直；在相当于盆腔淋巴结、输卵管、卵巢的部位有钙化灶；如碘油进入子宫一侧或两侧的静脉丝，也应考虑子宫内膜结核。③结核菌培养：如有条件可将月经血或刮出的子宫内膜作结核菌培养或动物接种。④其他：如血常规、血沉、结核菌素试验等可作为诊断的参考。