会，如果一个逻辑分区容量大于30G（FAT32分区），可能就会出问题了。因为FAT32的文件系统最大就30G。
不会，只有太小会影响
不会产生会什么影响
加快Windows 98启动速度
1、删除一些随Windows自动启动的程序。
Windows98在启动时会自动加载一些程序，这些程序一般放在两个地方，一个是"开始"菜单中的“启动”组，另一个是注册表。随着Windows下安装的程序的增多，特别是一些程序在Windows启动时也跟着运行，影响了Windows系统的运行速度。因此我们可以合理地配置这些启动程序，删除一部份不必要自动加载的程序。
改变虚拟内存大小
Windows的虚拟内存的大小决定了虚拟内存交换文件（C盘根下的Win386.swp）的大小。通过“控制面板”打开“系统属性”，点击“性能”→“虚拟内存”，然后选择“用户自己指定虚拟内存设置”，在硬盘选项中你可以指定虚拟内存交换文件存放的位置，并将最大值和最小值设成相同的一个值（选择64M～128M之间的一个数值即可或者通过系统监视器了解交换文件的大小范围再确定），太小有可能使系统无法启动，太大浪费磁盘空间，也可将“虚拟内存”的最大值设为磁盘可用空间的80％左右，最小值设为100MB左右。
这要看你的主板是否支持大硬盘，有些老式的主板不支持大容量硬盘，你就什么系统也装不上喽