人们在跑步时或结束后有时会感到部位疼痛不适。有些疼痛可以淡然置之，但有些疼痛则应引起重视。
首先应注意胸部出现的疼痛，它可能会波及肩部，这很可能是严重的心肌梗塞征兆。如疼痛不能马上消失，应立即请医生治疗。因为这不是呼吸困难、躁热等引起的疼痛，而是运动量过大所致。
接下来是头痛和腹痛。如果跑步停止几小时仍疼痛得很厉害，很可能出了问题，应到医院检查。相反，很多此类疼痛也可能是身体长期不运动的惰性反应，或者是运动量超过限度。
除了上述疼痛外，人跑动时，上肢会端起，很可能出现上臂或肩部的肌肉酸痛；为了防止头部下垂，颈部肌肉会比平时紧张，这样又会出现颈部肌肉僵直。背部肌肉有时也会酸痛。然而，跑步后洗个温水浴会感到轻松。