1普通集装箱，又称干货集装箱（dry container）：以装运件杂货为主，通常用来装运文化用品、日用百货、医药、纺织品、工艺品、化工制品、五金交电、电子机械、仪器及机器零件等。这种集装箱占集装箱总数的70~80%。
2冷冻集装箱(reefer container)：分内外置式两种。温度可在-28℃~+26℃之间调整。内置式集装箱在运输过程中可随意启动冷冻机，使集装箱保持指定温度；而外置式则必须依靠集装箱专用车、船和专用堆场、车站上配备的冷冻机来制冷。这种箱子适合在夏天运输黄油、巧克力、冷冻鱼肉、炼乳、人造奶油等物品。
3开顶集装箱（oper top container）：这种集装箱没有箱顶，可用起重机从箱顶上面装卸货物，装运时用防水布覆盖顶部，其水密要求和干货箱一样。适合于装载体积高大的物体，如玻璃板等。
4框架集装箱（flat rack container）：没有箱顶和两侧，其特点是从集装箱侧面进行装卸。以超重货物为主要运载对象，还便于装载牲畜，以及诸如钢材之类可以免除外包装的裸装货。
5牲畜集装箱（pen container）：这种箱子侧面采用金属网，通风条件良好，而且便于喂食。是专为装运牛、马等活动物而制造的特殊集装箱。
6罐式集装箱（tank container）：又称液体集装箱。是为运输食品、药品、化工品等液体货物而制造的特殊集装箱。其结构是在一个金属框架内固定上一个液罐。
7平台集装箱（platform container）：形状类似铁路平板车，适宜装超重超长货物，长度可达6米以上，宽4米以上，高4.5米左右，重量可达40公吨。且两台平台集装箱可以联结起来，装80公吨的货，用这种箱子装运汽车极为方便。
8通风集装箱（ventilated container）：箱壁有通风孔，内壁涂塑料层，适宜装新鲜蔬菜和水果等怕热怕闷的货物。
9保温集装箱（insulated container）：箱内有隔热层，箱顶又有能调节角度的进出风口，可利用外界空气和风向来调节箱内温度，紧闭时能在一定时间内不受外界气温影响。适宜装运对温湿度敏感货物。
10散装货集装箱（bulk container）：一般在顶部设有2~3和小舱口，以便装货。底部有升降架，可升高成40°的倾斜角，以便卸货。这种箱子适宜装粮食、水泥等散货。如要进行植物检疫，还可在箱内熏舱蒸洗。
11散装粉状货集装箱（free flowing bulk material container）：与散装箱基本相同，但装卸时使用喷管和吸管。
12挂式集装箱（dress hanger container）：适合于装运服装类商品的集装箱。