多年来，人们已经注意到有些抗生素可以促进溃疡愈合，因此认为某些细菌可能是溃疡病的致病因素之一。澳大利亚学者Warren和Matrshall于1983年从人胃粘膜中培养分离出幽门螺杆菌以后，发现此菌与溃疡病的关系非常密切。十二指肠溃疡患者的幽门螺杆菌检出率高达70%～100%，胃溃疡患者的检出率为60%一70%。溃疡病经药物治疗愈合后幽门螺杆菌仍阳性的患者，其溃疡复发率明显高于阴性的患者。幽门螺杆菌促发十二指肠溃疡的机制还不清楚，目前有几种假说：
1.胃酸分泌过多时，十二指肠球部被过度酸化，可以导致十二指肠内的胃上皮化生灶，为幽门螺杆菌从胃窦粘膜移居于十二指肠球部创造了条件。经研究证实，生存于十二指肠球部的幽门螺杆菌的确仅限于胃上皮化生灶中。该菌在球部生存繁殖而诱发慢性炎症，在其他致溃疡因素的作用下，发生十二指肠球部溃疡。
2.有些学者报告幽门螺杆菌阳性者的胃泌素释出量多于无此菌感染的患者，高胃泌素血症刺激壁细胞分泌胃酸增多，加重十二指肠球部的酸化而易发生溃疡
后台，关于幽门螺杆菌促使胃泌素增多的原因，可能与此菌含有尿素酶有关，该酶分解尿素产生氨，使胃窦局部的碱性(pH)增高，削弱了胃酸对胃窦粘膜中G细胞的反馈抑制作用，导致G细胞分泌胃泌素增多。