从农业税改革的长远方向看，十六届三中全会已经明确，要“创造条件，逐步实现城乡税制统一”。这就是说，要取消对农民和农业生产单独开征税种的传统做法，针对我国农业、农村、农民特别是农民收入的实际情况，按照公平税负和合理负担的原则，逐步用现代税收制度来替代现行的农业税制，实现税制统一。中央提出2004年取消除烟叶以外的农业特产税，总体上降低农业税税率1个百分点，有条件的地方可以进一步降低农业税税率或免征农业税以及温家宝总理在十届人大二次会议上明确宣布将在5年内取消农业税，都是沿着城乡税制统一的方向所采取的有力举措。