儿童肥胖一般来说，不需要使用药物，而以调整饮食和加强运动为主，除非他(她)已经是重度肥胖，并且有许多合并症时，方才选择药物。
减肥药物主要有食欲抑制剂(包括苯丙胺、氟苯丙胺、氯苯咪吲哚等)和促进代谢药(如甲状腺素制剂、口服降糖剂)以及众多的减肥中成药。不管使用哪种减肥药物，必须由医生同意和得到专科医生的指导，能不用的尽可能不用，或根本不用。倘若儿童肥胖合并高血脂者，可用泽泻10g，山楂10g，开水冲开，待温，每日当茶饮，或试服消胖美。经常爱睡觉的肥胖儿可用一些减肥茶、七消丸之类。食欲亢进伴有口疮、口臭的孩子可吃牛黄清胃丸。如因精神因素而多食的孩子，在其正常饮食之后，尤其是午休、夜卧之时，适当给安定片，或枣仁安神液之类。非单纯性肥胖，在经医院确诊之后，要按照医嘱进行服药。