该员工应该先去申请仲裁，不能直接诉讼。
本案例厂方的做法不合法：
1、厂方未为员工购买养老保险；
2、扣发员工工资；
3、劳动补偿金非年终奖，不可扣除。
如员工申请诉讼，诉讼费由厂方负责，员工将会胜诉。
个人看法
去找有关人事咨询一下。