水晶与玻璃的鉴别
1肉眼鉴定
水晶的色泽明亮而柔和，发青光；玻璃明亮而刺眼，发白光。水晶具凉感，而玻璃具温感，有圆、椭圆形小气泡。
2仪器检测
用偏光仪检查，水晶是非均质体，在偏光仪下呈四明四暗；玻璃是均质体，在偏光仪下黑暗。水晶的密度较玻璃大，在2.65重液中，水晶悬浮，而玻璃漂浮。
天然水晶与合成水晶的鉴别
天然水晶与合成水晶常从颜色、种晶、包裹体特征及双晶现象来加以区分。近年来还使用红外光谱仪，通过测定水晶中的OH和H2O的吸收峰来区别天然与合成水晶。
1肉眼观察
天然水晶呈棱柱状、柱面有横纹；而合成水晶呈扁平棒状、柱面有特殊的鱼磷状生长纹、无双晶等，且晶体中心有一平行C轴的籽晶。天然水晶常含有星点状、云雾状的气液包裹体。合成水晶则透明度较高，合成水晶平行籽晶有桌面灰尘状固态包裹替，并有圆、椭圆形小气泡。天然水晶较合成水晶更具凉感。
2仪器检测
用偏光仪检测，在正交偏光镜下，呈白、灰色并有明暗变化者为天然水晶；而有虹彩或呈紫蓝色者多为合成水晶。但天然水晶中个别垂直光轴者可有虹彩现象。根据经验，一串水晶项链，在正交偏光镜下，仅有2~3个具虹彩现象，则说明是天然水晶；反之，如果大部分都具有虹彩现象，则说明是合成水晶。
天然水晶与改色水晶的鉴别
改色水晶的颜色有紫、蓝、橙黄和绿色，且颜色均一，无不规则的片状色团。改色水晶没有天然水晶的色泽柔和，且时间长了要褪色，如改色紫晶会褪成黄色等。
改色水晶中的包裹体发生变化。如将含有棕黄色针铁矿包裹体的紫晶加热处理形成黄水晶，其中针铁矿脱水变成棕红色的赤铁矿。据此可判定黄水晶是否经过热处理。