用盐水选种，是“水选”的一种方式。精选作物或树木的种子时，通常采用这种方法。种子的比重和相同体积盐水的比重是不同的。譬如糯稻为盐水的1.10左右，粳稻和大麦在1.13左右，小麦和裸麦在1.22左右。把种子倒进浓度合适的盐水里，饱满完好、比重大的种子下沉，秕粒、病虫粒和破粒因比重小，会浮在水面被清除掉，这样很容易就选出优良的种子来。
不过，用这种方法选种，要掌握好盐水的浓度；最好用比重计来测定。如果没有比重计，可将已经溶解的盐水舀出一碗，然后放进一匙要选的种子，假使全沉下去，说明盐水太淡，应继续加进食盐；如果大部分种子飘在水面，说明盐水太浓，应加水稀释，直到大部分种子斜卧在碗底为止。
盐水连续使用多次，盐分会被种子带走，应适当加盐，以免浓度降低，影响选种质量。同时，种子经盐水浸泡，表面会受伤，因此，种子从盐水里捞出后，要立即用清水冲洗，然后才能播种