你想格式化系统盘，无非就是想重装操作系统。
因此，建议你使用正版的操作系统安装盘通过光盘启动来完成整个格式化、安装过程。
如果你确实要在DOS环境下格式化系统盘的话（操作系统的安装文件已全部在硬盘的另外一个区），我建议你先要弄清楚你的系统盘和存放操作系统安装文件的逻辑分区的存储格式是不是FAT32，如果是NTFS格式的话，一般的DOS系统是看不到的，也无法完成格式化，此时只能通过fdisk来重新分区，会造成你所有盘的数据丢失。
如果磁盘格式已经是NTFS的话，可以下载一个支持NTFS格式的DOS系统启动盘，这样子才能实现你的目的。