我们吃东西是为了吸收其中的营养物质，这些营养物质包括：碳水化合物、无机盐、脂质、蛋白质、维生素、水、膳食纤维。消化系统吸收这些养分是靠各种消化酶的帮助将宏观食物分解成分子级的小物质，例如蛋白质将被分解成多肽链，多肽链继续被分解成氨基酸。
总的来说消化系统本身参与的消化过程不会产生那些让人不愉快的气味；然而同时帮助我们消化食物的还有很多寄生在肠道内的各种细菌，它们对食物的作用过程中会产生各种各样的代谢产物，这其中就包括了那些令人作呕的味道（请注意：这些细菌对人体正常消化活动是有帮助的，甚至是必不可少的，对此感到恐慌的朋友大可放心）。另一方面，人体利用这些营养物质的时候产生的代谢产物中包含有那些气味难闻的物质，比如蛋白质在人体内最终代谢产物其中一个组分是氨，这是一种有恶臭的气体。
所有这些组成了让我们排泄物那么令人难耐的原因。