大多数药物可由母体经胎盘进入胎儿体内，部分可对胎儿造成损害，有致畸作用。故孕妇的用药原则是能不用则尽量不用，能少用就不多用，必须用时要权衡利弊，慎重用药。一般像板蓝根冲剂等中药制剂，对孕妇还是比较安全的。妇女在妊娠期间用药谨慎，是为了防止药物对胎儿的生长发育产生不良影响。一般而言，妊娠期间应尽量避免用药。感冒时，可适当休息，多喝开水，往往可不治而愈，如症状未改善，再用药物调治。在用药上必须斟酌，避免使用具有损害胎儿以致堕胎等副作用的药物。科学研究中发现许多可以使胎儿致畸的药物，一般将这些具有损胎作用的药物列为妊娠禁忌药。据药物对胎儿损害之程度，分为禁用、慎用两类：
禁用的药物有：巴豆、牵牛子、大戟、斑蝥、商陆、麝香、三棱、莪术、水蛭、虻虫等。
慎用的药物有：通经祛瘀、行气破滞以及大辛大热的药物，如桃仁、红花、大黄、芒硝、枳实、附子、干姜、肉桂等。
还有青霉素、磺胺、红霉素、洁霉素等，经动物实验及应用于人体，未证实对胎儿有危害，亦可应用。而抗病毒类药物，如病毒唑、病毒灵等则避免应用。还有卡那霉素、链霉素、四环素、氯霉素、阿司匹林和水杨酸制剂等，均对胎儿有损害，或有致畸作用，不能应用。