阴道是性交和精液的容受器官，阴道后穹窿池储存精液和精子以便精子上游进入宫颈和子宫。阴道内环境受卵巢激素的影响，在排卵期呈弱碱性有利于精子的成活。而阴道炎症时阴道内环境不利于精子的成活，影响精子的活动力和穿透力，减少了进入宫颈和子宫腔内精子数量，从而降低了受孕率。
现代生殖免疫学研究认为，阴道是重要的生殖免疫器官，其间含有丰富的巨噬细胞和浆细胞可识别精子抗原和病原体，并分泌IgA、IgG。阴道炎时不同的抗原和病原体所诱发的抗体类别和抗体滴度也不尽相同。已知正常阴道内IgA／IgG之比为1：2，滴虫和大肠杆菌感染时阴道产生的IgG、IgA、IgM明显增加，而IgE生成甚少。阴道炎时精子死亡和精子抗原的释放，促进了阴道内抗精子抗体的产生，其抗体滴定度明显增加直接影响了精子的成活率、活动力和穿透力，并降低受孕力。
阴道炎时细菌和病毒产生的内毒素可诱发巨噬细胞和中性粒细胞生成诱生型一氧化氮合成酶并产生一氧化氮。一氧化氮作为局部细胞毒因子可杀灭精子和抑制精子的活动力而致不孕。
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