句子的意思：即便点了菜，等菜上来也是需要花时间的
分析：
注文しても=即便点了菜
……ても……是接续助词，接在动词的连用形后，表示“尽管……也”、“即使……也”、“纵使……也”。例如：いくら頼んでも返事がない（请求多次还是不答复），注意，当接在拨音便、い音便、ない后面则变为“でも”。
料理が来る=菜上来，上菜
这个好理解吧，关键是其后面的，要把“の”和“に”分开理解。の是形式体言，接在动词连体形后面，代表前面这件事情即“料理が来る”。に是格助词，表示动作的目的、依据等，在这里是指为了什么花时间，或者说花时间的依据。
明白了吗？千万别把のに一起理解为逆接关系。