比较解剖学上的同源器官：鸟的翼、蝙蝠的翼手、鲸的鳍、马的前肢、人的上肢，这些器官的外形和功能很不相同，但它们都属于同源器官。同源器官的存在，证明凡是具同源器官的生物，都是由共同的原始祖先进化而来的。只有在进化的过程中，它们的生活环境不同，同源器官与不同环境适应，出现了形态和功能的不同。胚胎学上的证据，一是所有高等动植物的胚胎发育都是从一个受精卵开始的，这充分说明高等生物起源于低等的单细胞生物；二是像脊椎动物的鱼类、两栖类、爬行类、鸟类、哺乳类和人，彼此间差异十分显著，但是他们的胚胎发育初期都很相似，这也说明了高等脊椎动物是从某些古代的低等动物进化来的。
用解剖的方法研究比较脊椎动物的鱼纲、两栖纲、爬行纲、鸟纲和哺乳纲及其类群的器官、系统的形态和结构的一门学科。在研究过程中，也根据古脊椎动物的化石找到器官的同功或同源的依据，从而阐明脊椎动物各类别间的系统演化关系。为生物进化理论提供证据
比较解剖学通常是指脊椎动物的比较解剖学，它是对各类脊椎动物的器官和系统进行解剖和比较研究的科学。生物进化在比较解剖学上最重要的证据是同源器官。同源器官是指起源相同，结构和部位相似，而形态和功能不同的器官。