《资治通鉴》载，就在回程途中，李世民又忽然患上了“痈疽”，严重到了“御步辇而行”的程度，乃至“太子为上吮痈，扶辇步从者数日。”到了并州，民部尚书刘洎曾经晋见，“及上不豫，洎从内出，色甚悲惧，谓同列曰：‘疾势如此，圣躬可忧！’”此言一出，大祸立至，这位重臣便被李世民下诏，“洎与人窃议，窥窬万一，谋执朝衡，自处伊、霍，猜忌大臣，皆欲夷戮。宜赐自尽，免其妻孥。”按说刘尚书罪不至此，大约实情是他对外人透露过李世民所谓“痈疽”症的真相吧？
回到长安之后，李世民伤情并未好转，次年二月，“上疾未全平，欲专保养，庚午，诏军国机务并委皇太子处决。于是太子间日听政于东宫，既罢，则入侍药膳，不离左右。上命太子暂出游观，太子辞不愿出”，整整过了一年后，李世民才从伤病中恢复过来，“上疾愈，三日一视朝”。21年正月，高士廉死，李世民往唁，“长孙无忌在士廉丧所，闻上将至，辍哭，迎谏于马首曰：‘陛下饵金石，于方不得临丧，奈何不为宗庙苍生自重……’”可知李世民不但并未痊愈，身体很差，且因急于痊愈，又开始大量服丹。以致五月又不得不再度“诏百司依旧启事皇太子”，此后太子亲政，李世民当然也过问国事，但已是只抓大事了，身份近似太上皇，这一直到第二年五月他去世为止。
基本上可以判定，就李世民的身体状况而言，贞观19年亲征高丽确实是一个转折点，出征前的李世民是踌躇满志，意气风发，而失败之后则一病不起，从此再没有恢复过来。是失败的打击吗？当然不是，因为李世民最后的两年还曾两次议证高丽，并由李世绩统军出征过一次。那么答案就呼之欲出了，即李世民在他的人生最后一次征战中确确实实是栽了，不仅输掉了战争，甚至连“龙体”都陪上了。而其中缘由或并非偶不小心染恙，受伤的可能性应该是最大的。当然，这样的事情在战场上乃属最高军事机密，事后为皇帝的尊严和面子计也会千方百计加以掩饰，来自敌方的说法或判断无法找到真凭实据，有夸大其词的可能，不过相形之下反而更确实可靠一些。
