成蝇体粗短，全身有鬃毛，体分头胸腹3部分。
头部近似半球形，两侧有一对复眼，多数蝇类的雄性两眼距离较窄，雌性距离较宽。头顶部有3个单眼。颜面正中有一对触角。头的下方有口器，多数为舐吸式，可以伸缩折叠，末端有大的唇瓣，舐吸食物。吸血蝇类的口器为刺吸式，能刺入人畜皮肤吸血。
胸部可分为前、中和后胸。中胸有一对翅，上有6条纵脉，都不分叉。后翅退化为平衡棒。足3对，末端有爪和爪垫，着生细毛，能在光滑的玻璃上爬行，也容易携带病原体。
蝇卵为乳白色，香蕉形，前尖后粗，多粘在一起，形成团块。
苍蝇的幼虫又称蛆，乳白色，体表光滑，头端尖细，尾端钝圆，无眼无足。
蝇蛹由第三龄幼虫成熟后不蜕皮收缩而成，多呈桶形，棕黑色。