日本书纪（にほんしょき、やまとぶみ）是日本留传至今最早之正史，六国史之首，原名《日本纪》。舎人亲王等人所撰、于公元720年（养老4年）完成。记述神代乃至持统天皇时代的历史。全三十卷，采用汉文・编年体写成。系谱一卷，系谱如今已亡佚。
编纂的起因在于经壬申之乱而取得政权之天武天皇欲向外宣示自身之皇统而下令编成。
依《古语拾遗》所述，「上古之世，未有文字，贵贱老少，口口相传，前言往行，存而不忘。」在编纂《日本书纪》之前，并没有正式的文献记载，仅有口耳传说，且日本与韩国相同，当时以汉文作为正式的官方语言，考虑到文字之华美性，是以编纂《日本书纪》时，多半借用中国典籍上之文字，拿来描述上代所传承之传说，是其一大特色。
在《日本书纪》之外，当时亦有《古事记》《风土记》等等各种书籍传世，比照其纪录，或有重叠，或有相违，是纪录口传文学时必定产生之现象。由此可以想像，当时的传说以有多种版本，非一时、一地、一人所造，而《日本书纪》之目的，即在编列出为准之「定本」。
于《古事记》序中有云：「余闻诸家所传帝纪、本辞，有诡於事实者，或多加虚伪。若今不修其谬，唯恐数年之後，旨趣亡散佚矣。帝纪、本辞，乃我国组织之理，天皇政治之基，故欲撰帝纪、检旧辞，去伪、定真，使传後世。」目的之一，在令上古传说、神话、历史统一，有利於天皇政权。
就《日本书纪》之撰写背景，其史观以天皇家与中臣氏（藤原氏）为中心，而在斋部广成之《古语拾遗》提出後斋部‧忌部氏之史观後，其他氏族亦相仿行之，遂有物部氏史观之《先代旧事本纪》以及姓氏录等文献问世。
改攥部分，在于抹煞了「大友皇子」之即位纪录，将天智天皇死後定为天武天皇元年，主张天武天皇继位之正统性。 其後，於其馀史料中找到大友皇子之即位纪录，是以於明治三年，追谥弘文天皇。
目录
卷第一神代[上]
卷第二神代[下]
卷第三神武天皇神日本磐余彦天皇
卷第四绥靖天皇‧安宁天皇‧懿德天皇‧孝昭天皇‧孝安天皇‧孝灵天皇‧孝元天皇‧开化天皇[欠史八代]
卷第五崇神天皇御间城入彦五十琼殖天皇
卷第六垂仁天皇活目入彦五十狭茅天皇
卷第七景行天皇‧成务天皇
卷第八仲哀天皇足仲彦天皇
卷第九神功皇后气长足姬尊
卷第十应神天皇誉田天皇
卷十一仁德天皇大鹪鹩天皇
卷十二履中天皇‧反正天皇
卷十三允恭天皇‧安康天皇
卷十四雄略天皇大泊濑幼武天皇
卷十五清宁天皇‧显宗天皇‧仁贤天皇
卷十六武烈天皇小泊濑稚鹪鹩天皇
卷十七继体天皇男大迹天皇
卷十八安闲天皇‧宣化天皇
卷十九钦明天皇天国排开广庭天皇
卷二十敏达天皇渟中仓太珠敷天皇
卷廿一用明天皇‧崇峻天皇
卷廿二推古天皇丰御食炊屋姬天皇
卷廿三舒明天皇息长足日广额天皇
卷廿四皇极天皇天丰财重日足姬天皇
卷廿五孝德天皇天万丰日天皇
卷廿六齐明天皇天丰财重日足姬天皇
卷廿七天智天皇天命开别天皇
卷廿八天武天皇[上]天渟中原瀛真人天皇
卷廿九天武天皇[下]天渟中原瀛真人天皇
卷三十持统天皇高天原广野姬天皇
