马剑鹏(JianPeng Ma) 男，教授，博士生导师。1964年11月生。1985年于复旦大学化学系获学士学位；1995年获美国波士顿大学博士学位；1995-2000于哈佛大学化学系从事博士后研究。2000年起于美国Baylor医学院和Rice大学任职，现为副教授，终身教职。2005年受聘复旦大学兼职教授。2006年起受聘为复旦大学特聘讲座教授。
马剑鹏博士的研究领域为生物物理，计算生物学及结构生物学。主要致力于发展针对生物体系研究的新的计算方法，用以克服实验研究中的困难，与实验手段相结合解决复杂生物体系中的重要问题。他的研究在中低精度蛋白质结构与功能以及蛋白质折叠研究领域内处于前沿和主导地位。他发展的包含大尺度运动的多尺度多精度结构精化的方法大大推进了X光晶体衍射，低温电子显微镜和纤维衍射领域中柔性结构分子的精化。他最新发展的计算方法成功地应用于中等大小蛋白的折叠问题。马剑鹏博士课题组近年来在Nature, Science, Proc. Natl. Acad. Sci., Biophys. J.,J. Am. Chem. Soc.等国际著名杂志上发表论文53篇，并多次在国际学术会议上做邀请报告。因其在计算生物学和结构生物学领域的重要贡献，2004年获得Norman Hackerman 化学研究奖。
马剑鹏博士目前在复旦大学化学系和生物医学研究院开展结构生物学和计算生物学研究，招收硕士和博士研究生以及博士后研究人员。