分类地位：卓孢菌属是放线菌门、放线菌纲、放线菌亚纲、放线菌目、小多孢菌科的1属。
生物学特征：在气生菌丝和基内菌丝上形成6～10个（有时达20个）孢子的短链，直、弯曲或螺旋形，孢子表面光滑或有小刺，含有为液泡所包围的中央体；细胞壁组分Ⅲ型，全细胞水解物含马都拉糖；分枝脂肪酸含量较高。
代表种：绿藤黄卓孢菌。