南京农业大学农学院是我国创立最早的农学系科之一。在长达近百年的办学历史中，一大批新中国农业科技的奠基人和开拓者在该院任教，他们是：著名小麦育种家、中国科学院院士、前中国农业科学院院长金善宝教授，著名棉花专家、中国科学院院士冯泽芳教授，著名数量遗传和大豆育种家、前南京农业大学大豆研究所所长马育华教授等。此外，徐冠仁、庄巧生、蔡旭、鲍文奎、王绶、卢良恕、邹秉文、过探先等一代著名院士和学者在该院曾就读或工作，还培养了大批部省级领导、专家和教授，以及在农业战线各层次尤其是基层勤恳工作，默默奉献的社会主义建设者。经过几代人的艰苦努力，农学院已经建立了完整、成熟、先进的人才培养体系，形成了诚朴、勤奋、实干、创新的优良学风，构筑了结构合理、精明强干、勇于创新的学术梯队。
全院现有教职工155名，其中国工程院院士2名，长江学者特聘教授2名，教授32名，副教授38名，博士生导师37名，硕士生导师32名。中国工程院院士、著名小麦遗传育种家刘大钧教授，中国工程院院士、著名大豆遗传育种家盖钧镒教授，中国农业科学院院长、著名遗传育种家翟虎渠教授现在本院任教。建院以来，农学院已累计培养博、硕研究生2000余人。本科生近万人。
农学院拥有1个国家级重点实验室（作物遗传与种质创新国家重点实验室）、1个国家研究中心（国家大豆改良中心）、3个省部级重点实验室（教育部作物遗传与特异种质创新重点开放实验室、农业部作物生长调控重点开放实验室、江苏省信息农业高技术研究重点实验室)、4个省部级研究中心（农业部小麦区域技术创新中心、国家水稻改良江苏分中心、农业部转基因大豆安全检测和监测中心、江苏省植物基因工程技术研究中心）和10个校级研究所和中心、2个国家级重点学科（作物遗传育种、作物栽培学与耕作学）、1个农业部重点学科（作物学）、1个江苏省重中之重学科（作物学）、2个江苏省重点学科（农业信息学、生物信息学）。现有各类实验室8000㎡、温室800 ㎡、网室10000 ㎡、实验地60多公顷，在校本科生人均实验设备价值60000元以上。设有1个博士后流动站、9个博士专业、6个硕士专业、4个本科专业，招生培养多层次高级科技和管理人才。独立设有李扬汉奖助学金、黎怀德助学金、宁粳奖学金和新纪元树人奖学金等，作为对品学兼优和特殊贫困生的奖励资助。
农学院近年来承担国家"863"计划、"973"计划、"攀登计划"、国家攻关、国家自然科学基金、部省级科研课题和国际合作研究课题400多项，年均研究经费3000多万元。科研经费充足，科研成果累累。十五期间先后获得17项国家和部省级科技成果奖励、14项国家发明专利，8项植物新品种保护权、26项软件著作权，制定省颁标准43项，培育出28个大豆、小麦、棉花、水稻等省农作物新品种，出版专著、教材18部，发表学术论文872篇。农学院还与全国各行政事业、科研教学和企业单位建立了紧密的人才培养和就业协作基地。
农学院一贯注重国际合作与学术交流，先后与美国、日本、英国、加拿大、荷兰、韩国等国家的20余所大学和科研机构建立了长期的合作。近五年来，先后合作研究与接待交流人员达200多人次。
