南京市第三中学（南京市第三高级中学）坐落在白下区太平南路商业街。校址原为创建于光绪二十八年(1902年)的上元高等小学，而后 四易其名，1938年改为正始中学,1946年学校改称为南京市第三中学。从四十年代正始中学的“格物 致志 诚意 正心 修身 齐家 治国 平天下”；到五十年代的“诚朴 友爱 勤学 向上”；到八十年代“五有一和谐”的办学 蓝图和九十年代的“教学生学会做人，教学生学会学习”，学校贯穿着一条“治学做人”的办学理念。我们要 学习继承三中百年优良传统，根据新时期的要求赋予“治学做人”新的时代内涵。1995年被确认为南京首批重点高中。1997年彻底改建校舍，装备了现代化、信息化的教学设施设备，1998年被确认为江苏省重点高中，1999年被评为江苏省模范学校。2005年被省教育厅确定为四星级普通高中。先后获国家、省、市级荣誉称号三十几项，校女子排球队四夺世界中学生排球锦标赛冠军，更是名扬华夏、威振海内外。2007年8月26日，在王龙老师的主持下，中国内地学生首次与国际空间站宇航员“天地对话”。
现任校长：吕天纵
办学规模
根据2005年省教育工作会议精神，在市、区政府的决策和领导下，做优初中，做精高中。初中办学规模发展到10轨。适度控制高中发展规模，确保高中生源质量，高中办学规模一般在10-12轨。
构建“一校两部三区”的学校管理模式
根据2005年白下区政府有关教育布局调整的决定，从2006年7月起，通过两年的建设和调整，南京三中将建成“ 一校两部三区”的校园布局，即“三中高中（高一、二）校区（白下校区）”（白下路117号）、 “三中高中（高三）分校区（金銮校区）”（新街口羊皮巷原67中 ）、“三中初中校区（文昌校区）”（大行宫文昌巷63号）。其中白下路校本部主要为高中一、二年级办学点；新街口羊皮巷校区为高三年级办学点。“一校三区”建成后，全校的教学和办公条件将得到较大的改善，但学校的多校区管理将成为学校管理的新课题。学校综合兄弟学校的实践经历，精心研讨和反复论证，按照“一套领导班子，一套管理制度，统一调配人、财、物，各校区分类管理”的原则，制定学校管理的新办法，形成学校管理的新模式。
各校区地址
文昌校区（初中）：南京市白下区大行宫文昌巷63号。
白下校区(高一、高二）：南京市白下区白下路117号。
金銮校区（高三）：南京市白下区金銮巷2号（原67中校址）。
