清政府平定大小和卓叛乱、重新统一天山南北后，乾隆二十七年(1762年)设置伊犁将军，治所在惠远城(今新疆霍城县南)。伊犁将军为清朝新疆地区最高官职，统辖新疆南北两路，包括巴尔喀什湖以东、以南，额尔齐斯河上游，天山南北两路，直至帕米尔等地的军政事务。光绪九年(1883年)，新疆建省。辛亥革命后废除伊犁将军。
伊犁一直是新疆通往中亚的重要通道，历史上曾建有许多城镇在这里发展贸易。伊犁将军府旧址在霍城县惠远城内。
清代乾隆为了加强在伊犁地区的治理，在这里设伊犁将军，建惠远城，并陆续在其周围建起惠宁、绥定、广仁、宁远、瞻德、拱宸、熙、塔尔奇八座卫星城，统称为“伊犁九城”。现保存较好的是被称为“伊犁九城”之首的惠远城，是当时我国西陲军、政治中心的伊犁将军府所在地。
现城内还保留着将军府旧址，旧址坐北朝南。院内古木参天；厅堂、台榭、曲径、回廊，依然存在。小巧玲珑的“将军亭”已修缮一新，伫立在青松绿树之间。昔日将军府门前的一对造型奇特的石狮，仍存院内，神态逼真，惹人喜爱。
惠远古城中心矗立着宏伟高大的钟鼓楼，登楼远眺，城内外风光尽收眼底。历史上，洪亮吉、祁韵士、林则徐、邓廷桢、徐松等著名谪士们都曾在此地留下辉煌业绩。林则徐率民开通水利，巩固边防，为民造福，受到了伊犁将军和各族人民的尊敬和信赖。林则徐在惠远虽然只有两年时间，但其日记、诗抄、书信留传甚多。