该协会成立于1958年，是上海最大的自然科学和工程技术方面的科技学术团体，是发展科学技术事业的重要社会力量。其宗旨是团结和动员科学技术工作者以经济建设为中心，促进科学技术的繁荣和发展，促进科学技术的普及和推广，促进科学技术人才的成长和提高，促进科学技术与经济的结合；反映科学技术工作者的意见，维护科学技术工作者的合法权益，为科学技术工作者服务。
数十年来，该协会在建设社会主义物质文明和精神文明方面发挥了独特的作用。上海市科协是中国科协的地方组织，业务上接受中国科协的指导，其组织网络包括自然科学和工程技术等领域的161个学会、协会、研究会，共有会员21.7万多人。另外,上海地区15个区科协、4个县科协以及40多个国有大中型企业的科协也是上海市科协的基层组织。