厦门新站位于集美后溪镇，西北是后溪生活区，南面是大学园区。对外交通方便，距离高崎国际机场约10公里，到厦门本岛、海沧、同安和翔安中心区的距离均在20公里左右。直接与沈海高速公路连接，与高崎国际机场、厦门本岛以及岛外各片区均有城市快速路和厦门快速公交系统线路相通。