南京大学日语系成立于1975年，1977年正式招收本科生，1995年开始招收硕士研究生。目前该系共有中方教师13名，其中正教授2名，副教授4名，讲师5名，助教2名，是一只具有高素质、高学历、教学经验丰富的中青年教师组成的队伍。在国内外著名大学获得博士学位者4名，在读博士学位者4名，其余为硕士学位获得者，所有教师都有在日本学习或留学的经历。同时还聘任日籍专家2名。
日语系教师素有治学严谨、学风正派的精神。学生们学习态度端正、勤奋努力，刻苦好学的作风，在每年参加的日语能力一级测试和专业四、八级考试中都取得了名列前茅的好成绩。
日语系科教师近年来工承担研项目有国家教育部1项，国家社科“95”一般项目1项，国家社科“95”青年项目1项，回国博士科研基金项目3项，南京大学世川良一基金项目5项，南大社科项目2项。其中已经结项的国家项目有一项，校级项目有5项。在国内外学术刊物发表论文近百篇、译著30余本、主编教材5部、参考教材10余部。
近5年来本专业在本科生和研究生教学方面新开设了具有本专业特色的主干课程，如本科生的“高级视听”“日语应用文”“日本古典语法”“经贸日语”“日本时事”等，研究生的“日本文学批评”“日本社会问题研究”“日本比较文学与比较文化”“日本史专题研究”“让步语言学专题研究”“日本古典文学研究”“日本民俗学专题”等等。为社会共培养本科生上百人，共培养硕士毕业研究生25人。在国内用人单位受到一致的好评。年年来我校要日语专业毕业的本科生和硕士生的单位都占各语种第一位。在日本，南大的日语专业的本科学生和硕士学生同样受到欢迎。
同时日语系目前和名古屋大学、早稻田大学、大阪大学、北陆大学等有交流合作关，每年都选派本科生和研究生到相关的学校学习一年或半年。
