中华人民共和国香港特别行政区政府是香港特别行政区(Hong Kong Special Administrative Region)行政部门的总称，可简称为香港特区政府、特区政府或香港政府。於1997年7月1日香港回归中国时成立，取代原英国殖民地时期的香港政府，并沿用大部份制度。
虽然「政府」一词通常包括立法和司法部门，但根据香港基本法，香港特别行政区政府只是指香港的行政部门。
香港特别行政区政府的首长是香港特别行政区行政长官。
部门资料英文：Government of the Hong Kong Special Administrative Region of the People's Republic of China
行政长官 曾荫权（64岁）
成立年份 1997年
所属部门 中央人民政府
总部 香港中环下亚厘毕道中区政府合署
历史明万历元年东莞县分拆新安县以后(除清初迁界时期外)，今香港全境受位于今深圳南头的广东新安县延福乡管辖。1841年第一次鸦片战争尚未结束英军即登陆香港岛水坑口，同年成立香港政府，并出版第一份宪报。日治时期曾短暂受日军统治。1997年7月1日香港特区政府成立。
行政部门除行政长官外，香港政府由三层架构组成：
行政长官是香港政府的政府首脑，负责领导香港特别行政区政府, 此职位成立于一九九七年，大致代替香港总督的职权。辖下由三层架构组成：
第一层是司长，即政务司司长、财政司司长和律政司司长。他们均是由行政长官委任，负责制订香港政府最主要的政策，并直接向行政长官负责。
第二层是决策局，又称为政策局，职能类似英国政府的部长，负责制订、统筹及检讨特订范筹，如卫生、运输、保安等的政策，和监督属下执行部门的工作。所有决策局又共同组成政府总部。前行政长官董建华于2002年7月1日实行问责制之前，所有决策局均只向政务司司长或财政司司长负责；实行问责制后，改为直接向行政长官负责。2005年10月12日新任行政长官曾荫权在他首份施政报告中又改为决策局先向政务司司长和财政司司长汇报，二人才再向行政长官汇报。
第三层是部门，是政府政策的执行部门，例如卫生署、警务处等，首长皆为香港公务员。
另外少部分政府部门如廉政公署及审计署皆直属行政长官。
现任行政长官是曾荫权。
补充：(2002年7月1日—2007年6月30日）的十一局
公务员事务局
政制事务局
教育统筹局
环境运输及工务局
卫生福利及食物局
民政事务局
房屋及规划地政局
保安局
工商及科技局
经济发展及劳工局
财经事务及库务局
2007年7月1日运作的决策局
教育局
商务及经济发展局
政制及内地事务局
保安局
食物及卫生局
公务员事务局
民政事务局
劳工及福利局
财经事务及库务局
发展局
环境局
运输及房屋局
「三司十一局/三司十二局」是司长及决策局的统称。自前行政长官董建华於2002年7月1日实施问责制後开始被传媒使用。
第三层是部门，是政府政策的执行部门，例如卫生署、警务处等。
政府行政及行政会议行政会议由行政长官，官守成员及非官守成员根据基本法组成，是行政长官制订政策的顾问团。官守成员一般由各司长及局长出任，而非官守成员则由行政长官自行决定，他们主要来自其他行政机关的主要官员、立法会议员和社会人士。
公营机构香港政府除了有政府部门执行政策外，还有为数不少的公营机构，负责政府认为较需要社会人士参与的工作。这些机构由政府出资成立及资助，但不属于政府体制，较政府部门有较多的自主权。例子有：管理全香港所有公立医院的医院管理局、协助香港工业发展的生产力促进局等。
主权移交时各部门名称改变行政机构
香港政府改称香港特别行政区政府
行政局改称行政会议
布政司署改称政府总部
布政司办公室改称政务司司长办公室
财政司办公厅改称财政司司长办公室
律政署改称律政司
布政司署政务科改称民政事务局
布政司署宪制事务科改称政制事务局
其余原隶属布政司署的决策科（如：布政司署运输科、布政司署保安科等）均改称局（运输局、保安局）；其首长由司（运输司、保安司）改称局长（运输局局长、保安局局长）
总督特派廉政专员公署改称廉政公署
皇家香港警察改称香港警务处
皇家香港天文台改称香港天文台
人民入境事务处改称入境事务处
政务处改称民政事务处
政务总署改称民政事务总署
核数署改称审计署
职称
总督大致由行政长官取代
布政司改称政务司司长
财政司改称财政司司长
律政司改称律政司司长
总督特派廉政专员改称廉政专员
海关总监改称海关关长
政务专员改称民政事务专员
立法机构
见香港立法会
司法机构
见香港司法机构
另香港拥有自己的[香港区旗]和[香港区徽]。
香港公营机构
委员会
大学教育资助委员会 - 公民教育委员会 - 公务员薪俸及服务条件常务委员会 - 司法人员薪俸及服务条件常务委员会 - 安老事务委员会 - 平等机会委员会 - 策略发展委员会 - 投诉警方独立监察委员会 - 保安及护卫业管理委员会 - 青年事务委员会 - 古物咨询委员会 - 城市规划委员会 - 城市规划上诉委员会 - 香港吸烟与健康委员会 - 香港法律改革委员会 - 香港房屋委员会 - 纪律人员薪俸及服务条件常务委员会 - 首长级薪俸及服务条件常务委员会 - 消费者委员会 - 妇女事务委员会 - 教育统筹委员会 - 第五届东亚运动会筹备委员会 - 第29届奥林匹克运动会组织委员会马术委员会(香港) - 爱滋病信托基金委员会 - 选举管理委员会 - 证券及期货事务监察委员会 - 语文教育及研究常务委员会 - 竞争政策咨询委员会 - 临时建造业统筹委员会 - 香港中医药管理委员会 - 香港存款保障委员会 - 禁毒常务委员会 - 香港薪酬趋势调查委员会 - 共建维港委员会 - 交通咨询委员会 - 肺尘埃沉着病补偿基金委员会-最低工资委员会-华人永远坟场管理委员会
局
香港机场管理局 - 香港考试及评核局 - 香港学术及职业资历评审局- 广播事务管理局 - 医院管理局 - 市区重建局 - 法律援助服务局 - 职业训练局 - 职业安全健康局 - 雇员再培训局 - 职业性失聪补偿管理局 - 强制性公积金计划管理局 - 人类生殖科技管理局 - 工程师注册管理局 - 测量师注册管理局 - 规划师注册管理局 - 园景师注册管理局 - 房屋经理注册管理局 - 建造业工人注册管理局 - 建筑师注册管理局 - 社会工作者注册局 - 香港助产士管理局 - 脊医管理局 - 兽医管理局 - 地产代理监管局 - 空运牌照局 - 恩恤金评议局 - 酒牌局 - 财务汇报局 - 辅助医疗业管理局 - 辐射管理局 - 药剂业及毒药管理局 - 香港出口信用保险局 - 香港生产力促进局 - 香港物流发展局 - 香港旅游发展局 - 香港贸易发展局 - 香港航运发展局 - 香港港口发展局 - 香港艺术发展局 - 香港电影发展局 - 西九文化区管理局 - 香港奖券管理局 - 香港康体发展局
公营公司
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其他
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