为了进一步规范和加强本市非上市股份有限公司股权的管理，促进股份有限公司规范运作，防止股权违规交易，维护股东及股份公司的合法权益，根据“十六大”关于积极推行企业股份制改革、加强国有资产管理的精神，以及国家有关部门及地方政府管理非上市股份有限公司股权的要求，2002年11月25日，市政府决定实施本市非上市股份有限公司股权托管制度，同年12月27日在上海技术产权交易所内设立上海非上市股份有限公司股权托管中心。
2003年12月18日上海技术产权交易所和上海产权交易所合并，成立上海联合产权交易所，原非上市股份有限公司股权托管中心并入联交所，成为股权托管部。2004年8月经政府批准，将原归属于上海联合产权交易所内设的股权托管部，改制设立为上海股权托管登记中心有限责任公司，为本市专业从事非上市股份有限公司股权集中托管、过户、查询、分红等业务的股权托管登记机构。
根据上海市委、市政府关于要“探索和建立统一监管下的股权流转制度”的决定，本着“政府指导、市场引导、风险提示、打击违法”的原则，将本市非上市股份有限公司股权流动引导到托管中心和联交所的平台进行操作，这对切实保护投资者利益，规范本市非上市公司股权有序流动，将起到积极的作用。
上海股权托管登记中心
是经政府批准本市唯一专业从事非上市股份公司股权集中托管、过户、查询、分红等业务的股权托管登记服务机构。
上海股权托管登记中心与上海联合产权交易所的股权交易平台相连接，为上海非上市股份公司股权规范有序流动提供服务平台。
托管中心主要职能
登记职能 为托管企业提供便捷的股东确权登记、变更登记。了解掌握股权变动情况，定期或不定期向托管企业提供及时、准确的股东名册，向政府有关管理部门进行备案。
管理职能 受托为托管企业管理股东名册，对托管企业的股权从登记、变更、直至注销全过程的必备材料进行形式审查，对托管的股权进行日常登记管理。
服务职能 为托管企业及股东提供信息查询、代理分红派息、上市辅导、股权回购、投融资及企业要求的其他增值服务。
本中心接受托管公司委托，管理股东名册，并提供下列业务：
（一）股权托管登记业务：包括协助托管公司进行初始托管确权登记、开立股东帐户登记、股权过户登记等；
（二）股权托管服务业务：包括为托管公司提供及时、准确的股东名册、代理分红派息、受理股权凭证挂失、提供股权查询、协助办理股权冻结、为托管公司提供信息披露平台、其他咨询服务等。
（三）增值服务业务：主要指为各类企事业单位提供重组改制、财务顾问以及投融资等服务。
为服务企业的过程中，全程为客户提供包括经纪、法律、审计、评估等在内的专业化服务，并可协助办理工商、税务及国有资产交易后续的变更手续等。