南京雨花石博物馆坐落在雨花台风景区，原是安稳寺遗址。
雨花石是古长江的长年冲击形成，形状如鹅卵石，一般只有蚕豆大小，质地晶莹，放入水中，便显露出绚丽多彩的花纹颜色。因为个体小，便于收藏和欣赏，价格便宜，因此深受广大群众喜爱。去南京游玩的人都把雨花石当作旅游纪念品带回家。自1999年起，南京市每年举办一次雨花石艺术节，是极具特色的旅游“王牌”节目。
雨花石是南京的特产，几乎成了南京的象征，南京人为弘扬雨花石文化，普及雨花石的科学知识，南京雨花石博物馆于1990年4月对开放。1997年雨花台风景区又投资20余万元对其重新装修，增强了雨花石展出效果。
全馆展出面积500余平方米，分设五个厅，第一厅展出的雨花石图片；第二厅由“雨花石鉴赏”、“雨花石古谱”、“名人与雨花石”、“雨花石诗情”等四部分组成；第三、四、五厅展出工艺品100余件，以及自唐代至今的大量记载雨花石的文献资料和专题著作珍本等。