密教所立佛身，则先有理智之别，而后明理智互具，不二也。金刚界属智，故称智法身。胎藏界属理，故称理法身。智法身者，转识而成者。显教言：转八识成四智，而成报身。今密教教更转第九识，而成五智，以为金刚界智法身之大日如来。言第九识者，八识外更加庵摩罗识，即白净识。
五智即阿啰钵舍囊arapacana的翻译，顺次为大圆镜智、平等性智、妙观察智、成所作智、法界体性智。在显教有四智说，密教结合法界体性智成为五智，相应代表金刚界五佛阿閦如来、宝生如来、阿弥陀如来、不空成就如来和大日如来，对应于胎藏界中台五佛。
五智即代表五部金刚部、宝部、莲花部、竭磨部、佛部。第九庵摩罗识转化为法界体性智，第八阿赖耶识转化为大圆镜智，第七末那识转化为平等性智，第六意识转化为妙观察智，前五识共同转化为成所作智（即转识成智）；
若在瑜伽观想中，则佛部属于脐（脐莲花轮白色），金刚部属于心（心莲花轮红色），宝部属于脐下（座莲花轮金色），莲花部属于顶（顶莲花轮青色），竭磨部属喉（喉莲花轮墨绿色）；大日如来为常住清净妙法身，阿閦如来属于自性法身，宝生如来为他受用身，不空成就如来为变化身；
依照发心直至成佛过程，从东南西北到中央，依次表示通达菩提心，修菩提心，成金刚心，证金刚身和佛身圆满；代表五佛智慧轮身的，依次为金刚萨埵、金刚藏王、文殊师利（或者观音）、金刚牙；
五佛各有教令轮身：大日为不动明王，阿閦为降三世明王，宝生为军荼利明王，弥陀为大威德明王，不空为金刚夜叉明王；
在护摩修法中如果欲调服魔怨则修降三世明王法，如果欲增益则修军荼利明王法，如果欲求敬爱则修大威德明王法或者孔雀明王法，如果欲钩召有情则修金刚夜叉法，如果欲息灾则修不动明王法。
凡夫之九识，可成如来之五智。但此五智，不过一如来智慧之分为五分而已。实际上，五智必归合为一如来智，且随举一智，其他之四智，亦包含在内。
金胎两部曼荼罗，各有五佛，即金刚界，中央五大月轮中，有大日、阿閦、宝生、无量寿、不空成就五佛。胎藏界，中台八叶院，有大日、宝幢、开敷华王、无量寿、天鼓雷音五佛。如是五尊，均表五智。大日如来五智具足，其余之四佛，亦各具五智。如是重重无尽。
