奴儿干都指挥使司，简称奴儿干都司，一作奴尔干都指挥使司，明官署名。成祖永乐七年（1409）置，是中国明朝明成祖时在东北黑龙江出海口一带（今俄罗斯境内）所设立的一个军事统治机构。治所在黑龙江下游东岸特林，有卫、所四百余，屯驻军队，为当地军政机构。辖区东至海，东北包有库页岛，西至斡难河（鄂嫩河），南接图们江，北抵外兴安岭。永乐十一年（1413）与宣宗宣德八年（1433）曾二次在特林修建永宁寺，并立有二碑。清光绪三十年（1904），二碑被帝俄政府劫去，移置海参崴博物馆。
奴儿干，亦称“耦儿干”、“努而哥”，或作“纳尔干”。据《黑龙江古代简史》载，清人称为尼噜罕（满语“国画”之意），表示这里山川如画，风景秀丽。奴儿干都司，是明朝在黑龙江下游设置的管辖黑龙江、乌苏里江流域等地区的最高地方军政合一建制。明朝建立后，公元1375年（明洪武八年），在东北地区南部设置辽东都指挥司使。1395年（明洪武二十八年），明总兵官周兴等进军到脑温江（今嫩江）、忽刺温河（今呼兰河）和斡朵怜（今依兰县城西马大屯）一带，派官招抚，始建卫所制，设指挥使和千户。1409年（明永乐七年），明廷决定，升奴儿干卫为奴儿干都指挥使司，简称“奴儿干都司”，驻奴儿干城（今黑龙江下游黑龙江与亨滚河汇合处右岸的特林地方，即元朝征东元帅府的故地）。奴儿干都司为地方最高一级的军政合一建制，直隶于明朝中央政府。明廷经常派遣钦差大臣到奴儿干地区巡视。太监亦失哈从1411—1433年（明永乐九年至宣德八年）的22年中，曾10次前往视察，对都司、卫、所官员授予官职、印信，赏赐衣物钱钞。并在奴儿干都司的山顶上，修建了永宁寺，先后留有“敕建永宁寺记”和“宣德八年重建永宁寺记”两块石碑（现藏于俄罗斯海参崴博物馆）。
奴儿干都司辖区，幅员辽阔，西起鄂嫩河，东至库页岛，北达外兴安岭，南濒日本海和图们江上游，包括黑龙江流域和乌苏里江流域至库页岛的广大地区。辖区内广置卫、所，作为都司所属的地方军政建制。在奴儿干都司建立前后，1403—1409年（明永乐元年至七年），陆续在松花江、嫩江、鄂嫩河、精奇里江、亨滚河和乌苏里江流域设立130余卫，到万历年间（1573—1620年），奴儿干都司辖区内增加到卫384、所24、地面7、站7、寨1，通称384卫。16世纪末至17世纪初，以努尔哈赤为首的建州女真逐渐取代了明朝对黑龙江地区的统治。
成立背景过程明成祖永乐元年（1403年），明朝派人至奴儿干地区招抚，次年各部归附，朝廷任命各首领为指挥同知等职，其后数年，明朝即以此为基础，逐渐在黑龙江、乌苏里江流域成立了一百三十一个卫，永乐七年（1409年），在当地官员忽剌修奴的建议下，在黑龙江入海口一带成立都指挥使司以统辖各卫，以康旺为都指择同知，王肇舟为指挥佥事。
统治情形奴儿干都指挥使司的统治范围东、南及于海、并越海抵苦夷（库页岛），西至斡难河（今鄂嫩河），北至外兴安岭。
其对于东北地区的统治并非直接掌管，而仅是在重要地点设军事据点及发展交通路线，各族实质上仍由各部族自行统治，而除少数官员之外，大多数官军人员由当地部族人民担任，中央间或派遣人员加以巡视宣慰各族人民。明成祖之后，对于东北的经营较不重视，该地官员大多成为世袭而不受中央控制，英宗正统年间，正式废除了奴儿干都司。
