COMMAND.COM是Windows 9X中的DOS外壳程序(SHELL)，较DOS 6.22仅增加了部分内部命令，没有更新的东西。
IO.SYS对COMMAND.COM的处理则有了根本改变，当Win 9X在CONFIG.SYS中加载EMM386.EXE驱动提供UMB时，COMMAND.COM的常驻部分装入HMA，暂驻部分装入UMB中(在DOS6.22中，COMMAND.COM只能将常驻部分装入HMA)，这将为DOS程序提供更大的常规内存，也不需要反复从磁盘中恢复暂驻部分，有效地提高了系统性能。当然，如果没有加载EMM386.EXE，系统不提供UMB，COMMAND.COM的暂驻部分就只能象DOS6.22那样置于常规内存的高端。
DOS内部命令的程序代码存放在command.com文件中，它在DOS系统启动的时候随DOS的启动模块一起被调入计算机内存。