1966年11月，北京红卫兵浪潮席卷全国之后，以王洪文为首的上海造 反派夺了上海市委的领导大权。接着，南京的造反派也夺了江苏省委的大权。一夜间，南京街头贴满打倒“许大马棒”的大字报。第一批大字报，对许世友还算“温和”，但造反派很快升级，抄了许世友的家，扎烂了他的上将礼服。
在张春桥策划下，造反派给许世友定了调子：许世友在延安就要杀毛主席，搞暴动，现在他又要做六省一市的头，不千刀万剐不足以平民愤。
许世友的政治生命岌岌可危。
很快，毛泽东南巡到了上海，明确表示要保许世友。毛泽东说，他没有谋害我嘛，我把他从(延安)监狱找出来的嘛。
毛泽东还叫张春桥坐空军的飞机去接许世友。
许世友恨透了张春桥，他认定北京有奸臣，第一奸臣就是张春桥。这回毛主席派张春桥来接，是毛主席的意思?还是张春桥的阴谋呢?路上被他害了怎么办?
许世友粗中有细的对安徽省军区司令员、政委说，我对主席忠心耿耿，而对这个“四只眼”，我太不放心。万一半路被杀，你们帮我办两件事，一是我死后，请照顾我的几个孩子，上学、当兵都行；二是十天内没有我的消息，赶快派人到上海收尸，把我运回老家新县埋了。记住，千万不能送火葬场。
还好,许世友一路平安到了上海。毛泽东说，世友啊，你还好吗?许世友二话不说，扑通跪倒在地，磕了很响的一个头，放声大哭。满腹的痛苦都在这滚滚的泪水中。
毛泽东连忙把大哭的许世友搀扶起来。许世友说： “天下大乱，从未乱到这种程度啊，军人手中的武器连烧火棍也不如了，这是什么世道?毛主席啊，你该管一管了。你知道谁是忠臣，谁是奸臣吗?”毛泽东顿了片刻说： “世友，我信任你，南京军区党委是可以信任的，你还是南京军区司令员。不许揪许世友，这是我的意见，我派人打电话给他们，你回去也传达我的意思，你看这样行吗?” “不，什么时候打仗，我什么时候下山。”“那你先到北京学习。”许世友还是没有同意。
许世友早就看出“文革”来之不善，要留得青山在，只有天高皇帝远。虽然有毛泽东一句顶一万句的当面承诺，许世友还是返回了大别山。
冠冕堂皇的理由是许世友说到大别山检查战备工作。考虑到大别山重要的军事基地众多，许世友呆在大别山确实能阻挡一阵子。别看文革成员横行一时，但此时借给他们三个胆子也不敢进大别山。
许世友尽管躲进了大别山，但危险并没有过去。
1967年8月，南京借批陈再道(武汉军区司令员)的“东风”，正在筹备在五台山体育场召开批斗许世友的十万人大会。 9月1日，周恩来打电话给江苏造反派，说中央要保许世友，这是毛主席的指示。9月底，周恩来亲自打电话给许世友，说毛主席请你来北京参加国庆。
自从“文革”以来，许世友一直对北京敬而远之。表面看许世友是大老粗，直线思维，实际上心非常细，警惕性非常高。
周恩来怕许世友不相信，叫陈锡联跟他讲，周恩来深知许世友和陈锡联的生死之交。陈锡联对许世友说，我们都在中南海，你也来吧。许世友保证，我一定去北京。你报告总理，我身体不好，爬也要爬上飞机。
1967年国庆节，许世友被毛泽东请上天安门城楼，谈了半个小时，并公开见报。这在文革中非同一般，表明许世友是毛主席司令部的人，谁也不敢再找他的麻烦。之后许世友住进中南海40多天。每天没事，与李先念、陈锡联、余秋里等一大批避难的老将在棋盘上“杀”得不亦乐乎，过了一段“打仗”的日子。
1968年1月28日，周恩来为许世友上台大造舆论。周恩来在宣读并解释中共中央、国务院、中央军委、中央文 革小组对南京军区党委检讨报告的批示时说，军队支工、支农的成绩是最主要的，他们已经检查或改正军队在支左中犯的“错误”，中央同意这个检查。南京军区是中央所信任的，许世友同志是一位身经百战、久经考验的好同志，在国内革命战争、抗日战争、解放战争中，都立下了很重大的功劳。这—点必须肯定。
3月20日，中央批准了南京军区党委关于江苏省成立革命委员会的报告，同意许世友担任革命委员会主任。
许世友上台后的第一件事就是解散江苏省境内的各种造反组织，并在一份文件上批：谁再造反，先杀后报!
从此，许世友在文革的旋涡中游刃有余。
