真菌的营养体生长发育到一定阶段，即开始形成繁殖器官，便延续后代，继续生存。这种为延续后代而进行繁殖的器官，称为真菌的繁殖体。真菌的繁殖主要是产生大量的孢子，相当于高等植物的种子。根据真菌产生孢子的方式不同可将真菌的繁殖区分为无性繁殖和有性繁殖。
无性繁殖：无性繁殖是没有经过性细胞结合，而直接由营养体转变而成的繁殖方式。无性繁殖所产生的孢子叫无性孢子，常见的无性孢子有孢囊孢子、游动孢子、分生孢子、芽孢子、粉孢子、厚垣孢子。
有性繁殖：有性繁殖是经过两性细胞结合的繁殖方式。有性繁殖产生的孢子叫有性孢子，有性孢子常见的有接合子、卵孢子、接合孢子、子囊孢子、担孢子。
真菌的子实体：在高等真菌中，有性孢子或无性孢子都可能聚生在一种由菌丝构成的组织中，好像高等植物的种子生在果实里一样，这种着生孢子的特殊结构称子实体。常见的子实体有分生孢子器、分子孢子盘等，它们为无性子实体。而子囊果（又可分为子囊壳、子囊盘、闭囊壳）、担子果为有性子实体（见图11）。
