一般的医院会说卵巢囊肿手术治疗虽然效果比较好，但是不能盲目的选择手术治疗方法。良性卵巢囊肿的手术治疗应该选择输卵管卵巢切除术。此方法适用于一侧卵巢囊肿发生于年龄较大(45岁以上)患者之双侧卵巢囊肿多行一侧或双侧输卵巢切除术，患者周身情况不能胜任或炎症严重者常行全子宫切除术，值得注意的是关于较大卵巢囊肿的手术处理，应不计切口大小，以完整切除为宜，以免弄破患者脉搏内容物溢入腹腔或切口。
这毕竟要开刀，复发率不定，时间也有早有晚，针对这种情况，MLD微镜激光卵囊多点分解技术就显得与时俱进有科学人性了，
它不开刀微创治疗，不会出血，也不会损伤其他组织，先行控制消除囊肿分泌物，避免囊肿进一步发展，是目前最安全的治疗方式，永不复发；激光对囊肿组织小分子分解剥离，不伤及卵巢，创口小，感染率几乎为零；中药及生物促性腺素的采用，多管齐下，疗效确切，绿色治疗不伤及卵子，免去受孕后的后顾之忧。
北京华博亚太不孕不育研究院结合280例卵巢囊肿、多囊卵巢病例的治疗经验，有针对性地开展医疗技术研究，历时两年成功研发出了这一套系统的针对卵巢囊肿和多囊卵巢等病的不孕症治疗技术。
国内外对卵巢囊肿的治疗多采用手术，化疗、放疗等，但大多难以治愈，恶性肿瘤病程短，发展快，根据恶性程度高低手术切除的多少或放化疗的敏感度，复发有早有晚，手术后瘤体还会再复发、再生长因此大部分患者手术后仍然会再复发，建议大家不宜采用。