肿瘤的命名可分为普通命名法和特殊命名法两种。普通命名法根据肿瘤的生物行为、解剖部位、组织结构、细胞类型等而定。
根据生物行为可将肿瘤称为良性瘤、交界瘤与恶性瘤。恶性瘤中来源于上发的称为癌，来自间叶非上皮性的组织称为肉瘤；又根据恶性程度而称为低度恶性、中度恶性及高度恶性肿瘤；根据生长方式可称为原位癌、浸润癌、转移癌；根据波及范围可你早期癌、中期癌和晚期癌以及原发性癌、继发性癌。根据解剖部位可称为食管癌、胃癌、大肠癌、肝癌。鼻咽癌、肺癌、乳腺癌、宫颈癌、皮肤癌等。根据组织可称乳头状瘤、乳头状癌、囊腺瘤、囊腺癌、绒毛状腺瘤、管状癌、腺样囊腺癌、叶状囊肉瘤、腺泡细胞癌、腺泡状软组织肉瘤、葡萄簇肉瘤、滤泡型癌等。根据细胞来源可称为鳞形细胞癌、基底细胞癌、移行细胞癌、腺瘤、腺癌、精原细胞瘤、神经鞘瘤、神经节细胞瘤、软骨肉瘤、骨肉瘤、平滑肌瘤、横纹肌肉瘤等。根据细胞的形状可称为梭形细胞癌、燕麦细胞癌、印戒细胞癌、上皮样肉瘤、星形细胞瘤等。根据细胞的大小称为大细胞癌、巨细胞癌、小细胞癌等。根据细胞的染色反应可称为嗜银细胞癌、嗜铬细胞瘤、嗜酸细胞瘤。嗜碱细胞瘤、嫌色细胞瘤、透明细胞癌等。根据细胞内所含的内容可称为粘液腺癌、黑素瘤、浆液腺瘤。含内分泌激素的可称为生长激素瘤、催乳素瘤、胰岛素瘤、胃班素瘤等。根据细胞的颜色可称为棕色瘤、绿色瘤、黄色瘤等。
特殊命名法无一定规律，一般来自传统习惯或特殊情况的约定俗成。如以人名命名的有尤文氏（Ewing）瘤、卡波氏（Kaposi）瘤等。以“母细胞瘤”命名的有：视网膜母细胞瘤、神经母细胞瘤、母细胞瘤、脂肪母细胞瘤等。以“病”命名的有：何杰金氏（Hodgkin）病、白血病、尊样霉菌病等。以地名命名的有：地中海型淋巴瘤、非洲淋巴瘤等。还有一些疾病，本质上不是肿瘤而称为瘤的，如石蜡瘤、胆脂瘤、淀粉样瘤、动脉瘤等。
