单细胞虫黄藻肉眼看不到，但它对水族箱中的动物和水质具有非常重要的功能。这些共生的海藻，它们以多到不可思议的数量累积寄生在中空状动物中，例如：软珊瑚、贝类、石珊瑚及八放珊瑚等。它并不仅只是一般单纯的共生而已，而是在动物及植物体内，以极精确的方式进行的基础内部共生。共生性单细胞虫黄藻无法在毫无屏障的水中生存，而只能寄居在中空状动物之中。这种“永远寄生”是无脊椎动物维持生命所必需的，且对无脊椎动物的健康与生存有极重要的决定性。与珊瑚进行极亲密共生单细胞虫黄藻，可提供养分与氧给其共生对象，并能从重碳酸钙中摄取二氧化碳，然后将未溶解的碳酸钙堆积起来作为珊瑚躯体的骨架。在很多动物中，单细胞虫黄藻都能够完全提供它们的食物来源，并将它们照顾得很健康。这是一种完全封闭式的循环，也几乎等于是全部的再循环。
在良好的光照和水流下，单细胞虫黄藻可以经由动物表面吸收硝酸盐、磷酸盐、氨基酸及其他有机化合物，并将它们转化成珊瑚的养分。因为这些出色的海藻，珊瑚就可以无须依赖外界的食物来生存。
单细胞虫黄藻在动物寄主的组织中所受到的保护比其他种类的海藻都要好。但要保持这些不可或缺的单细胞虫黄藻，则必须符合下列三个要求：
大量的光照。
强力水流运动以确定养分能不断地在供应。
维持钙与二氧化碳的平衡状态。
单细胞虫黄藻最不能忍受的就是长时间的黑暗，一旦在这种状况下便会很快死去，可以由动物寄主转变为苍白而轻易辨识出。
