陆军远东研究办公室－－每年回国两次，接受新任务
该办公室隶属于美国陆军研究办公室，主要负责搜集日本技术和装备的发展动向，并向陆军科研机构提供情报。为给美国陆军的各种研究、开发项目提供技术支持，他们经常安排美国陆军科研人员访问日本军方研究机构，还时常主办各种技术学会及研究会，定期与美国其他对外技术情报搜集组织交流信息，其目的是获取最前沿的技术情报。
1992年以前，该办公室仅有一名科研联络官员，每逢遇到较大规模活动时，不得不到海军研究办公室亚洲室借调人员。1993年以后，该机构迅速扩编，联络官增至4名，还增加了5名轮驻科研人员和1名机动人员。据悉，联络官每年至少要回国两次，在带回情报的同时还要授领新任务。
该办公室深谙日本社会交际之道，不惜花血本拉“关系网”，不仅与日本科研机构建立定期互访机制，还与日本防卫厅、自卫队官员关系密切。有报道称，该办公室通过隐秘手段，与日本某些情报机构有联系，还建立了情报共享机制。
环境科学技术办公室
紧盯高科技，严防核扩散
该办公室设在美国驻日大使馆内，隶属于美国务院东亚·太平洋局，由7名科技人员和4名行政人员组成。
为确保同日本社会的联系，4名行政人员都由日本人担任，技术人员中有两人具备专业背景，3人精通日语。其主要任务是搜集日本科技情报，尤其是核技术发展动向，以防发生核扩散现象。
据披露，该办公室通过一个被称为STRIDE的计划，将搜集到的情报通报给美国国家技术情报局，然后转发给政府及非政府机构。据说，日本国内高科技领域的一举一动，都会被反映到STRIDE的通报中。
1969年5月，日美就冲绳返还问题进行交涉，日本驻美大使馆向日本外务省拍发密电，就如何处理美军秘藏在日本的核武器一事进行磋商。磋商的一举一动及相关细节都被美国了如指掌，而日本政府却一直蒙在鼓里。直到1985年，当年的美军情报人员著书披露此事时才真相大白。
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海军研究办公室亚洲室
学者职员担当“暗探”
为有效掌握日本海军基础科学研究进展，美国海军研究办公室在东京设立亚洲室，负责搜集某些尖端领域研究开发的最新成果。该室由4名科学联络官、1名访问学者及5名工作人员组成。联络官必须同日本科技出版界保持良好的私人关系，且必须是政府或产业学术界的高级研究员；访问学者则必须精通日语，还要在日本发表过多篇科学论文。
该办公室的情报搜集手段很多，除公开的技术文献资料外，还经常派人出国访问，必要时，还会直接出面组织科学技术研究会，广邀各路学者与会，以伺机套取所需资料。
陆军远东科技中心
顶级专家5年更新一次
该中心位于东京横田基地，隶属于美国陆军资料司令部，由1名指挥官、13名技术人员及19名行政人员组成，其中有军人也有文职人员。技术职员都是精挑细选的顶级专家，每五年更换一批，以保证其在该领域的领先地位。
中心主要搜集日本时效性强的技术情报资料，特别对日本先进应用科技研究有独到见解。工作人员不定期出席各种会议，以便搜集有价值的最新情报。他们还跟日本政府及民间科技人员私交密切，从中获取情报。其他五大机构
空军第一分遣队
分遣队位于东京横田基地空5军司令部内，主要为空军部队在该地区行动提供技术情报，同时也负责搜集亚太地区的科技情报，如航天航空武器系统及相关辅助设备性能、尖端技术项目及产品动向等。分遣队还负责为作战司令部制定、调整作战预案，提供情报支持。
国防技术办公室
该机构隶属于美国驻日大使馆美日相互防卫援助办公室，由一名负责人和海、陆、空三军各一名参谋组成，同时还有数量不定的访问学者。主要负责搜集亚洲地区的高新技术情报。此外，还负责协调美国防部与日本防卫厅技术部门间的关系，促进日本高新技术向美防务产业转移。
能源部驻东京办事处
该办事处设在美国驻日大使馆内，有技术人员3名，他们精通日语且具备技术、商业及经济背景。主要通过监视日本科技文献，同日本政府、科技界及民间科研人员进行定期会晤等形式，搜集与能源开发相关情报资料，并及时向能源部报告。
亚洲航天航空研究开发办公室
该办公室配有精通日语且具备技术经验的3名研究人员，还有一些科技及行政人员。其主要任务是监视日本在航天领域的科技研发活动，并对其国防关键技术做出预测。其工作人员除依靠公开出版物获取情报外，还有选择地参加特定的会议及研究会，并定期访问日本学术界、政府以获取情报。
国家科学财团驻东京办事处
该办事处设在美国驻日大使馆内，由1名科研人员和4名日籍职员组成。主要负责同日本政府及产业界的沟通，以及搜集日本科学政策及科技发展方面的情报。
该机构主要对日本通商产业省的预算及立项情况进行监视。其科研人员通过阅读公开出版物，或出席日本政府、民间会议的方式，来搜集所需的科学情报。
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美对日武器研发严密设防
自上世纪90年代以来，美国对日政策变得有些微妙，一方面希望强化美日同盟，借以推行其亚太战略，另一方面又担心日本超过自己，不再听自己“招呼”。为此，美国明显加大了对日掌控力度，特别是在防务技术上层层设防。
首先，迫使日本更多地购买美国武器，在关键领域对日本严密设防。20世纪90年代，美国同意日本根据美国许可证生产F-15J战斗机，但对其关键装置——中央计算机处理装置却拒绝向日本转让技术，使得其国产率只有55%。此外，美国还对日本卫星技术层层设限，据日本防卫厅知情人士透露，日本卫星的许多关键零部件都来自美国，日本“太空开发事业团”只负责组装和发射，这是日本卫星发射不时出事的重要原因。近年，美国向日本提供的武器零部件，越来越多地采取“黑盒子”方式出口，使得一心想拆解、研究、模仿的日本人无技可施。
第二，要求日本转让军民两用技术，借日本高技术武装自己。一直以来，都是美国向日本转让军事技术，但近年情况发生了变化。在看到日本的技术优势后，美国强烈要求日本提供其在民用产品领域掌握的尖端技术，并多次派专家赴日调查。其中，三菱公司的导弹技术、东芝公司的激光技术等，都被美国列入“征用”名单。
第三，以共同开发的形式，牢牢控制日本武器研发和生产。F2战斗机就是一个典型事例。一开始，日本打算自行研制F2战斗机，美国通过“眼线”察觉日本这一意图后，做出了强烈反应，认为这是向美国发出“挑战”。在经过长时间的争吵后，迫于美国的压力，日本不得不同意其中40%的零件由美国提供，并将它独立开发的新型“隐形”技术、超地平线雷达等无偿提供给美国。
