这里主要讲述由细菌、病毒、真菌和寄生虫等引起的胃肠炎、小肠炎和结肠炎。临床表现有恶心、呕吐、腹痛、腹泻、稀水便或粘液脓血便。部分病人可有发热及里急后重感觉，故亦称感染性腹泻。
分类常见以下几种：
① 细菌性肠炎。发病机理较为复杂，致病菌借菌毛粘附于肠粘膜上皮细胞,使细菌能在肠壁生长繁殖,成为致病的先决条件。细菌性肠炎的病原菌可分产肠毒素性和侵袭性两大类。不同病原菌引起的肠炎，有不同的发病机理和临床表现。
肠毒素性细菌性肠炎。如霍乱，发病机理是致病菌粘附而不侵入肠粘膜，在细菌生长繁殖过程中分泌肠毒素，和小肠粘膜的上皮细胞膜受体结合，激活细胞膜上的腺苷酸环化酶，在该酶的催化下，使细胞内的三磷酸腺苷 (ATP)转化成环磷酸腺苷(cAMP)。当细胞内cAMP的水平升高时，通过一系列的酶反应，使小肠粘膜大量分泌水和电解质,潴留在肠腔内引起水泻,称为“分泌性腹泻”。此类病人除小肠粘膜上皮细胞有分泌亢进外，肠道的病理改变往往没有或者很轻。病原体主要感染小肠，因此基本临床表现是腹泻次数较多，为大量水样便，无脓血，一般无腹痛,无里急后重感,常伴有呕吐，容易发生脱水、电解质紊乱及酸中毒，全身中毒症状较轻。大便镜检常无红、白细胞或极少。
侵袭性细菌性肠炎。如细菌性痢疾，致病菌粘附并侵入肠粘膜和粘膜下层，引起明显的炎症。不同的病原菌侵犯肠的部位不同，有的侵犯小肠为主，有的侵犯结肠为主，有的引起小肠和结肠炎症。此类肠炎的基本临床表现是：全身毒血症明显,有高热,重症病人可发生感染性休克。大便可呈粘液脓血便，便量少，便次多。腹痛明显，呈阵发性绞痛。若病变侵及下部结肠特别是直肠，可出现里急后重感。乙状结肠镜检查，可见弥漫性炎症及溃疡。若仅侵袭小肠或上部结肠，则大便含水量较多，不伴里急后重。大便镜检有多数白细胞，尤其是下部结肠炎时更为明显。
② 病毒性胃肠炎。见病毒性胃肠炎。
③ 寄生虫性肠炎。由原虫和血吸虫引起较为多见。原虫性肠炎中以阿米巴痢疾较多。雅尔氏虫和滴虫均可引起肠炎。血吸虫病在流行地区较为常见，可以表现急性和慢性腹泻、稀便或粘液脓血便。
④ 真菌性肠炎。见肠道菌群失调。
诊断因病原不同而异。一般应根据流行学史和临床表现初步加以判断。进一步确诊需依赖实验室检查。细菌性肠炎可作呕吐物及大便培养，获得病原菌即可确诊。有些病原菌如沙门氏菌感染可作血培养。病毒性胃肠炎可用电子显微镜、免疫电镜、免疫荧光及血清学检查如补体结合试验、酶联免疫吸附法及放射免疫法等检查病毒的抗原和抗体。也可用组织培养法分离病毒。寄生虫性肠炎可直接镜检，寻找病原体及其虫卵。真菌性肠炎可从大便中直接涂片，在显微镜下检查真菌或作大便真菌培养。
⑤ 其他
治疗主要有以下几方面：
① 病原治疗。病毒性肠炎一般不需病原治疗，可自愈。肠毒素性细菌性肠炎一般也不应用抗菌药。侵袭性细菌性肠炎，最好根据细菌药物敏感试验结果选用抗菌药。患细菌性痢疾时，因痢疾杆菌对常用抗菌药广泛耐药，一般可选用复方磺胺甲基异唑（复方新诺明）、吡哌酸、庆大霉素、丁胺卡那霉素等。空肠弯曲菌肠炎可用红霉素、庆大霉素、氯霉素等治疗。耶尔森氏小肠结肠炎杆菌肠炎一般应用庆大霉素、卡那霉素、复方磺胺甲基异唑、四环素、氯霉素等。沙门氏菌肠炎轻型病人可不用抗菌药，重型病人可用氯霉素或复方磺胺甲基异唑。侵袭性大肠杆菌性肠炎用新霉素、粘菌素和庆大霉素等治疗，可获良好效果。阿米巴痢疾、雅尔氏鞭毛虫和滴虫引起的肠炎，可用甲硝哒唑（灭滴灵）治疗。血吸虫病可用吡喹酮治疗。白色念珠菌肠炎以制霉菌素口服，疗效较好。伴有全身性真菌感染者，则需应用二性霉素B治疗。
② 补充液体及纠正电解质和酸中毒。轻度脱水而且呕吐不重者，可口服补液,WHO推荐的口服液配方为氯化钠3.5g，碳酸氢钠2.5g，氯化钾1.5g,葡萄糖20g或蔗糖40g,加水1000ml。脱水或呕吐较重者，可静脉输入生理盐水、等渗碳酸氢钠和氯化钾溶液以及葡萄糖。
③ 减少肠道蠕动和分泌性药物。可小量应用阿托品、颠茄、普鲁本辛以减轻肠道蠕动，可止痛及止泻。也可应用氯丙嗪，有镇静作用，并可抑制肠毒素引起的肠粘膜过度分泌，使大便次数及便量减少。
