在临床上，HPV有多达几十种分型，不同的分型可以导致不同的疾病。根据HPV亚型致病力大小或致癌危险性大小不同，可将HPV分为低危型和高危型两大类。低危型HPV主要引起肛门皮肤及男性外生殖器、女性大小阴唇、尿道口、阴道下段的外生性疣类病变和低度子宫颈上皮内瘤，其病毒亚型有HPV6、11、30、39、42、43型及HPV44型。高危型HPV除可引起外生殖器疣外，更重要的是引起外生殖器癌、宫颈癌及高度子宫颈上皮内瘤，其病毒亚型主要有HPVl6、18、31、33、35、45、51、52、56、58型和HPV61型。