灼口综合征目前尚无统一的诊断标准，因而给准确诊断带来困难。一般临床上依据该病的临床表现和症状来诊断。
1、口腔粘膜烧灼样疼痛，或具有异常感为主诉；
2、疼痛无固定位置，以舌表面为主。
3、无全身性器质病变，如贫血、糖尿病、结缔组织病等；
4、病人未服慢性病药物，如心血管等常用药；
5、局部检查舌部以及口腔粘膜无器质性病变；
6、患者不符合精神分裂症等心因性精神障碍的诊断。
参考文献：http://kq.dsmzyy.com/KQZX_jbcs_xx.asp-id=3249.htm
灼口综合征的诊断要点
[诊断] 诊断BMS时应注意以下几点：
1．口腔粘膜(以舌表面为主)烧灼样疼痛，或具有异常感为主诉；
2．舌部以及口腔粘膜无器质性病变；
3．无全身性器质病变，如贫血、糖尿病、结缔组织病等；
4．未服慢性病药物，如心血管等常用药；
5．不符合精神分裂症等心因性精神障碍的诊断。
目前尚无统一的诊断标准，因而给准确诊断带来困难。一般根据舌或口腔其他部位的烧灼样疼痛等异常感觉，在空闲时加重，在工作、吃饭时反而减轻或消失，以及临床症状与体征明显不协调的特征，可以作出诊断。但必须首先排除三叉神经痛、舌癌、舌部溃疡、舌淀粉样物质沉积等器质性病变。在询问病史时应注意详细询问发病过程、既往史、服药史、有无社会心理影响因素和伸舌自检不良习惯等。局部检查应注意义齿情况、残根残冠、唾液腺功能等。血糖、性激素水平等检查有助于发现系统发病因素。
[鉴别诊断] 应与舌部溃疡、舌癌、舌淀粉样变性、三叉神经痛、舌乳头炎等鉴别。以上病损均有明显体征，且与临床症状相符。