扁当局用“台湾”的名义申请加入WHO被驳回，陈水扁相当火大，用平时骂大陆的话骂WHO秘书处。陈水扁说，WHO秘书处刻意矮化台湾，甚至还要求台湾的官员要冠上“中国台湾”的称谓，真是是可忍孰不可忍，实在是太过分了。
东森新闻报道，陈水扁跟WHO的梁子结大了，4月初用“台湾”的名义申请加入WHO，吃了闭门羹，又赖是中国大陆打压。
陈水扁说：“WHO的秘书处竟然说，我们不是一个‘主权国家’，所以不要处理，这是全体会员国共同要决定的事，不是秘书处可以片面否决，看有多过分，有多可恶多鸭霸！”
陈水扁越说越气，把WHO发给台湾的公文都抖出来：“说我们只能用个人的名义参加，层次一定要处长以下，更过分的，任何资料文件要把我们的专家代表说他是来自中国台湾，是可忍孰不可忍。”
在陈水扁心中，中国大陆的“打压”岂止如此，就连办奥运也有政治考量。
陈水扁说：“他说这是国内路线，不是国际路线，台湾不是他们的一部分，咱是‘主权独立的国家’，我们绝对不能接受，中国任何的打压跟矮化。