小邦与多马收到讨伐盗贼的请求，又再度搭档合作。敌人假装成盗贼，在地中挖掘某种东西。敌人的真面目是与红色欧卡诺伊多一起行动的少年希尔兹。希尔兹控制的忍者豹把小邦与多马诱进基地，企图抓住两人。但在菲妮与奇克的帮助下两人逃了出来，打退了忍者豹部队。
第40集 狩猎洛伊德
为了战争而被集结在一起，最后又遭到废弃的无人军团，被不明人士给偷走了。小邦被派去调查，而且因而与阿帕因再度相逢。敌人用输送巨鲸来回收洛伊德，抽出洛伊德之核做实验。小邦跟阿帕因、多马一起打倒敌人，破坏那个实验场所。原来敌人的首领是希尔兹。
第41集 恶魔的迷宫
在帝国领土的荷尔斯亚德。力杰占领了炸弹的解体工厂，企图引爆炸弹。小邦与多马虽然已经赶到，但是力杰控制了多马的大哥，卡尔．修巴鲁兹的精神，逼这对兄弟自相残杀。卡尔的格斗金刚ＭＫⅡ与多马的攻击野牛展开了壮烈的战斗。
第42集 雷温
如同行尸走肉一样的雷温，陆续对帝国、共和国的基地发动攻击。小邦与菲妮收到有人目击到黑色欧卡诺伊多的情报，大受震憾。在失火的基地中，小邦与雷温重逢了。雷温见到小邦后，神情才首次恢复正常。然后如同在呼应雷温一般，屠杀魔龙也觉醒了。
第43集 皇帝的假日
以未婚妻自许的玛丽安与微服出巡的鲁道夫跑来找小邦与菲妮。可是奖金猎人史丁卡已经把目标对准鲁道夫了。另一方面，玛丽安看出多马对菲妮的单相思，决定用各种办法来让多马得到菲妮的芳心，可是....。失恋受到打击，独自在荒野中徘徊的多马面前，突然出现了屠杀魔龙，并对攻击野牛发动攻势。
第44集 机兽激烈大冲突
多马与雷温交手战斗，结果惨败。小邦知道屠杀魔龙复活的消息，准备因应与雷温的战斗。阿帕因与慕蓓为了协助小邦，也聚集到基地来拟立对策。这时屠杀魔龙出现，与超重剑长牙狮展开激烈战斗。可是影子在战斗中让屠杀魔龙脱逃，变成一个大茧。
第45集 漆黑之翼
在雷多利班基地。成为希尔兹属下的拉尔夫跟缪拉偷出了苍茫翼龙，向共和国的基地发动攻击。应战的小邦等人因这些洛伊德拥有隐形功能而陷入苦战。这时罗素与薇欧拉赶至，展开激烈的空中战斗。苍茫翼龙对抗苍茫翼龙，会是谁胜谁负呢。
第46集 海底的恶魔
小邦与菲妮两人被Ｄ博士找来雷姆利亚岛，本以为Ｄ博士会想出可以打倒雷温的计划，结果Ｄ博士却叫小邦去散散心。于是不得已只好到处闲逛，菲妮却跑不见人影。小邦带着奇克到处寻找菲妮，偶然在洞窟中发现了Ｄ博士的研究室。Ｄ博士说按照遗迹发现的古文书的一个章节记载，传说当两个月亮交会在一起的时候，海底会浮上神秘的遗迹。照电脑计算，这一天就是那个晚上。时间一到，岛屿的水位果然下降，果然现出了海底遗迹。欣喜的众人并不知道，力杰已经在遗迹设下圈套要陷害小邦．．．。
第47集 魔兽新生
帝国军终于把雷温抓起来。修巴鲁兹逼问雷温，普罗因兹是如何得到屠杀魔龙复活过程中偶然产生的洛伊德破坏暴龙。但是雷温坚持不肯回答。这时候，小邦提议抢在屠杀魔龙破壳而出之前，把光茧破坏掉。进行准备时，战友阿帕因跟慕蓓也赶来帮忙，让小邦高兴不已。可是，众人合力却迟迟无法摧毁光茧，屠杀魔龙新生了..
