怪医黑杰克21 剧情梗概：大结局
黑杰克与21年前抛弃自己跟母亲的父亲（间影三）重逢之后，就出现企图取他性命的神秘组织，这一切绝对是和父亲身边的人事物有着关系。就在此时，黑杰克在恩师本间医师的医院里发现了一张相片，不知为了什么原因，本间医师与父亲一起在相片里，解开谜团的关键就在这张相片，为了揭穿这个巨大的阴谋，黑杰克与皮诺可展开冒险之旅。
企图夺取黑杰克性命的神秘组织是谁？充满谜团的“黑色计划”究竟是什么呢?
怪医黑杰克21 分集剧情介绍：
第1话 医师证照回来的日子
一心想要逮捕黑杰克医生的友引警部，在黑杰克替他儿子医治好十分难治的狮面病后，也决心要帮黑杰克申请医师执照，然而桀骜不驯的他看不惯医师会那些医生的嘴脸，再次放弃考执照的机会于是被抓进监牢里，直到医师会会长自己的儿子遭枪击，来求黑杰克医生动手术…
第2话 BJ与父亲的重逢
留在录音机的一名男子的声音，以及黑男这个名字让黑杰克又想起儿时的回忆，当时他与母亲一起遭遇到未爆弹的意外，黑杰克在接受本间丈太郎医师奇迹式的手术后捡回一条命，可是母亲却过世了，而他的父亲竟然在此时狠心丢下他们母子，相隔21年后才出现要求黑杰克为他现在的妻子动整型手术，要把她变成这世上最美的女人…
第3话 悲伤的皮诺可
黑杰克医生从父亲间影三那里回来后，立刻就遭遇到未爆弹的意外，虽然警方并没有挖到他的遗体但是种种迹象显示黑杰克已经死了，皮诺可虽然不愿意相信，但是老板先前就受黑杰克所托要让皮诺可被人收养，伤心的皮诺可也不得不接受这样的命运…
第4话 北欧的黑色天使
黑杰克为了调查在本间医师医院中发现的相片，和皮诺可来到北欧找克罗杰尔博士，没想到克罗杰尔却在两个月前车祸变成植物人，而该院的迪文副理事长还要提供高额费用，请黑杰克假扮成院长公开为一个癌末的母亲动手术…
第5话 机械手臂
黑杰克和皮诺可这次来到修达因综合医院，拿着那张相片要问修达因博士21年前的事，以及他提到的关于"黑色计划"的事，正巧在这里遇到木实女医师，并且因此为她的病患特里顿进行手术，让他免于被切断手臂装上机械手臂的遗憾…
第6话 空中医院
黑杰克为了追知道黑色计划的修达因博士，急着赶往英国，不料机场人员表示要再确认他的身份不能马上让他出境，结果就在此时黑杰克遇到曾经看过他动刀的西川医师，这位女医师表示可以带黑杰克前往英国，并且是搭乘由白拍子医师开发的空中医院…
第7话 百亿圆的生命约定
黑杰克在中东的某个小国家，被一名醉汉指认为杀人凶手，刑警不分青红皂白逮捕他还对他刑求幸好一个在这里偶遇的日本人蚁谷出面作证，把黑杰克从黑牢里救出来，黑杰克想酬谢他蚁谷都不收，于是他们约定好如果蚁谷生病或受伤时黑杰克绝对会医好他，没想到后来蚁谷被那个神秘组织的杀手追杀…