《深呼吸》分集介绍：第16集
雷思成将借来的十万元钱交给肖秀萌，并劝其慎重考虑控告药厂的事情，因为这是牵一动十的的事情。而两人的见面被特意跟来的孟子凡看到。在孟子凡的质问下，雷思成说出与肖秀萌十二年前的往事，孟子凡心中留下深深的芥蒂。
黄明哲被派到香港作药厂上市前的准备，从一位老友口中，黄明哲偶然知晓李洪刚私吞了国家一亿多元公款的事情，惊恐不已。而黄明哲的异常行为已引起李洪刚的注意。
极风药业的排污暗渠被挖开，立刻引起多方的震惊。高华带着药厂工人赶往现场阻止。冲突中，谢重天被打成重伤送进医院。雷思成气急，要对极风药业采取治理措施，却遇到来自上级领导的施压。这场冲突后，周飞扬被电视台停职，小刘也被药厂列入黑名单。
《深呼吸》分集介绍：第17集
李洪刚为了给雷思成以警告，将雷思成的借款条及他与肖秀萌秘密相见的照片交给了孟子凡，这件事再度点燃孟子凡心中的怒火。
高华派手下教训了黄明哲一顿，并警告他将口风把紧。黄明哲向李洪刚提出辞职，并前所未有的直言劝其改过。
雷思成开始着手调查二甲基硝酸胺，谢重天无奈坦白了自己的疑虑，他怕雷思成与药厂有着钱权关系，而偏袒药厂。雷思成明确表示自己和极风的关系是干净的。谢重天释然，满怀信心对极风药业展开调查，将《深呼吸》分集介绍：第一个突破口放在李汉桥的身上。在众人的不懈坚持下，李汉桥终于鼓起勇气向雷思成交待了隐瞒多年的药厂污染的事实。雷思成意识到问题的严重性，决定对药厂进行全面调查。李洪刚与雷思成的战斗，正面开始！
《深呼吸》分集介绍：第18集
李洪刚应对雷思成的《深呼吸》分集介绍：第一步，就是将知晓内幕的黄明哲的嘴永远的封上。而黄明哲似乎预感到这一天的来临，事先将有关资料交给了吴晓霜。
黄明哲突然死亡引起吴晓霜与周飞扬的怀疑，众人找到雷思成，说出心中的疑虑，而雷思成却表现出超乎寻常的冷静。警方初步鉴定黄明哲是自杀，但种种迹象表明事有蹊跷。
李洪刚以扩建地下水管道的名义，让高华派人暗中毁掉排污暗渠。肖秀萌奋不顾身上前阻挡，暂时阻止了李洪刚蓄谋已久的破坏。雷思成立即下令停止扩建，在排污事件水落石出前一律不许动工。李洪刚气急败坏，便以雷思成与肖秀萌在宾馆见面的录像带相要挟，雷思成终于看清李洪刚的本来面目。
而孟子凡始终摆脱不掉雷思成与肖秀萌种种可疑之处，私下将雷思成与蕾蕾的血样做DNA亲子鉴定，结果显示蕾蕾竟然是雷思成的女儿。这一事实造成了孟子凡与雷思成之间难以弥补的裂痕。
《深呼吸》分集介绍：第19集
吴晓霜建议肖秀萌暂时留在医院照顾蕾蕾，她担心孟子凡干涉雷思成给蕾蕾捐献干细胞，肖秀萌这才意识到问题的连锁反应。
雷思成约肖秀萌在公园见面，雷告知自己已经知道与蕾蕾的父女关系，询问肖秀萌这十年的情况。肖秀萌承认十二年前隐瞒了怀孕的事实，为了雷思成的前途而选择放弃两个的感情，雷思成对突然多出的女儿有些不知所措。
孟子凡面对家庭巨大的变故，与雷思成的关系越来越紧张。肖秀萌非常内疚，找到孟子凡试图解释清楚与雷思成的关系，却没想到孟子凡选择要退出三人复杂的关系。
李洪刚将带头上诉告状的几个活跃分子的行踪牢牢控制在视线之内，当得知谢重天去了香港，李汉桥无故回了老家，李洪刚命高华不惜一切代价追查两人。
《深呼吸》分集介绍：第20集
李洪刚察觉到雷思成与蕾蕾之间有着某种不可告人的关系，为了控制雷思成，李洪刚以蕾蕾相威胁，这一点恰巧击中了雷思成的痛处。
肖秀萌一心照顾生病的蕾蕾，耽误了上诉进程，遭到药厂居民埋怨与不解。雷思成到医院为蕾蕾抽血，却被记者围堵。雷思成措手不及，仓皇避开。李洪刚承认这一切都是自己的杰作，算是给雷思成一个警告。紧接着，李洪刚又将雷思成与肖秀萌在宾馆见面的录像带交给孟子凡，孟子凡再也无法面对雷思成，收拾行李搬进了医院宿舍。
高华将李汉桥绑回浠水市，李汉桥被迫说出证据藏于何处。此时，谢重天也回到浠水市，将收集来得李洪刚犯罪证据交给雷思成。
《深呼吸》分集介绍：第21集
雷思成决定立即起草一份正式报告，请求法院、检察院共同介入调查。洪刚以曾经帮助过雷思成贿选市长相要胁，劝其换届选举的关键时刻要顾及前途。雷思成不为所动，正告李洪刚一定要追查到底。
在上告药厂的关键时刻，肖秀萌为难了：雷思成和极风药业有着千丝万缕的关系，如果上诉牵连到雷思成，会不会影响蕾蕾的治疗。
当看到丈夫骤然憔悴、虚弱的面孔，孟子凡忍受着心灵的极大痛苦，将家里仅剩的钱交给雷思成，让其还给李洪刚，雷思成承受着来自各方的巨大压力，坚守着一个信念，一定要为人民负责，站好最后一班岗！
李洪刚为了掩盖事实，千方百计地要将肖秀萌置于死地，一项精心筹划的阴谋正在悄悄地进行。李洪刚收买尤大勇，让其对尤二勇暴死事件翻案。
《深呼吸》分集介绍：第22集(大结局）
李洪刚最后一搏寄予孟子凡的身上，利用孟子凡心疼丈夫、悍卫家庭以及对肖秀萌的不满情绪，让其将尤二勇的病理标本偷换，推翻原先的结论。孟子凡在爱与恨、嫉妒与宽容、正义与自私中煎熬着。肖秀萌再次被拘留，病重的蕾蕾无意中听到冬冬失踪的消息便擅自跑出无菌仓，生命垂危……李洪刚洋洋得意看着自己一手导演的事件将要得逞时，雷思成、谢重天和李汉桥毅然地走进纪检委。
孟子凡终于意识到自己的所作所为不仅没能帮助丈夫，反而加重了丈夫的污点，使事态更为严峻；内疚、自责、愧悔终日缠绕着孟子凡，尤其在得知癌症村状况之后，医生的职业感、道德感更让孟子凡的良心备受煎熬。孟子凡将交代材料交给周飞扬，就在肖秀萌被无罪释放的那一刻，孟子凡选择了结束自己的生命。
黄哲明的命案也水落石出，凶手被绳之以法。
肖秀萌在一次次的磨难中涅槃重生，从被动到主动，从个人的儿女情长到成为众多受害者的代言人，执着地坚信法律的公正，走上了法庭的原告席……
