此后，巩向光又将真名单提供给余沁斋，以获取其信任。此前，地下党在传送名单的过程中，钉子已经将名单复制并提供给余沁斋。余沁斋将两发名单核对后，发现完全一样，不免大惑不解。
鉴于陈雨轩与巩向光之间的矛盾，边国烈将文启智案交给欧阳荷审理。欧阳荷审后将结论定为陈雨轩公报私仇。此时，边国烈又得到情报，称延安的中统潜伏人员全线破灭。于是边国烈将陈雨轩拘捕送交重庆。
钉子王济华此时已被地下党识破，巩向光在地下党的配合下，消除了钉子。
余沁斋被任命为中统渭城主任，开始捣毁地下党的联络点，但一无所获。
余雪瑶受人之托，请巩向光为教育局孙局长雪“冤”。巩向光了解情况后，一一指说其劣行，使余雪瑶对社会黑暗有了一些了解。
秦剑将上级同意去延安的消息告诉巩向光，巩向光以去延安重建情报网为由说服余沁斋同意此行。
《特殊使命》分集介绍：第三十集
巩向光的延安之行刚有眉目，张主任突然通知取消行程，这又在出乎巩向光意外，他感到命运对他的捉弄有些太残酷了。但余沁斋、边国烈也已同意延安之行，他找不出不去的理由，只得让武平在街头袭击自己，用伤势作为借口。巩向光的被袭引起了多方猜疑，巩向光顺水推舟，将众人的视线引向严锟。
严锟则开始对郑力祥实施招纳计划，准备在必要时让郑力祥除掉巩向光。郑力祥的反常行为引起了余雪瑶的怀疑和批评，为此郑力祥和武平两人吵了起来，兄弟矛盾由此而生。此时，余雪瑶有了身孕。
巩向光得知地下党的电台密码即将被破译，于是通知秦剑停止使用电台。延安为此将派遣特派员来渭城。这一消息也被重庆获得，中统总部也派专人将情报送给余沁斋。余沁斋指示朱然负责抓捕延安特派员洪定坤。
洪定坤按约定到茶楼与秦剑接头。
《特殊使命》分集介绍：第三十一集
特务将茶楼包围，秦剑为掩护洪定坤脱身而被捕。
军统副站长冯贤章在妓院面见郑力祥，迫使郑力祥作为线人监视巩向光在家中的举动。郑力祥从妓院出来时，恰被武平发现。兄弟二人为此争吵以至动起手来。郑力祥佯作改悔。
巩向光伤愈得知秦剑被捕，地下党找到巩向光让其设法营救秦剑，而余沁斋则让巩向光接手秦剑的案子，欲借此试探巩向光。边国烈则派欧阳荷协助巩向光，意欲一探巩向光的真伪。巩向光面临严峻考验。
余雪瑶因妊娠反应强烈，住进医院。巩向光在从医院回家途中，偶然发现郑力祥出入妓院，本来心情极坏的巩向光怒不可遏，打了郑力祥一耳光。郑力祥则认为是武平告了他的状，从此兄弟二人反目。
《特殊使命》分集介绍：第三十二集
为营救秦剑，巩向光定下计策并要求地下党配合。
某日晚，巩向光又在节余上喝得大醉。欧阳荷与康莉将其送回家，在返回时被地下党劫持出城。第二天，康莉被放回，她跑到余沁斋处求救，说地下党要求用秦剑来交换欧阳荷。欧阳荷的特殊身份使余沁斋不得不答应对方的条件。
严锟此时觉得巩向光过于危险，不能不除，于是让肖文富逼迫郑力祥毒死巩向光。郑力祥犹豫再三，最终同意了。
巩向光为确保营救行动成功，请陈静雷帮忙。陈静雷得知要营救的正是击毙六指神、为自己报杀母之仇的恩人时，立即同意派人助战。
康莉在为地下党与中统之间传递交换人质消息的同时，被军统跟踪。严锟立即推断出其中奥秘，决定派人秘密前往交换人质的地点。
郑力祥在家中借送茶之机，欲毒死巩向光，不料事有意外，未能成功。
交换人质的行动开始前，余沁斋突然称有事不参与行动了。于是巩向光押解秦剑赶赴交换地点。严锟也带人隐藏在交换地的树丛中。（转载注明：剧情频道 电视节目表）
交换开始后，军统突然出现，巩向光、陈静雷的人与军统交战。秦剑与地下党趁机脱身。秦剑为掩护洪定坤孤身一人撤到河边，被隐在树丛中的余沁斋击伤，巩向光舍身去救，途中被郑力祥从身后开枪击伤。欧阳荷见状将郑力祥击毙。
巩向光要与秦剑一起过河去延安，两人在河水中争执起来。
《特殊使命》分集介绍：第三十三集
为了保护巩向光，秦剑大骂巩向光叛徒并开枪自尽。巩向光终于没有跑向河对岸。
由于秦剑牺牲，洪定坤决定暂时停止渭情处的活动。
巩向光对郑力祥之死怀有疑虑，认为欧阳荷在搞鬼。而秦剑的牺牲，再次引起一些地下党员对巩向光的怀疑与误解，洪定坤决定停止与巩向光的联系。另一方面，余沁斋也巩向光在河中的行为有所怀疑。而巩向光只能对武平说明秦剑牺牲的实情。
余雪瑶得知巩向光受伤，不顾身孕要去探望。余沁斋未能拦住，她一下滾下楼梯，以致流产。
严锟将巩向光的通共材料上报重庆，蒋介石亲自批复逮捕巩向光。
边国烈接到逮捕巩向光的命令，让欧阳荷到巩向光家进行试探。欧阳荷将实情相告，并提醒他天黑时才会行动。然而巩向光未理会她的暗示，安排了一下后事之后，自己毅然走向司令部。这令边国烈摸不清他到底是不是共产党。
