序幕：生化奇兵
“似乎我再也无法认得Raputre了。我听说他们已经把人们都聚集到阿波罗街区了…..”-Diane McClintock。
“目前蛋正在被收集。Ryan将记下Fontaine，或者Fontaine将记下Ryan。”-安全主管Sullivan。
1960年，中大西洋
轰轰然，主角掉落水中，经过挣扎浮到水面原来飞机失事了…….海面满是大火，赶紧一路狂游到前方一个貌似小岛的地方，刚上岸便看到飞机尾部慢慢沉入水中了…….走入前方有光亮的房屋后，屋子大门将自动关闭。此时房屋灯将自动打开。在入口可以看到一块牌子，上面写着些什么：“象我这样的人将在何种国家容身呢？-ANDREW RYAN”看来是某个家伙的留言。下楼梯进入一个球形潜水器，搬动开关进入海底世界…….
突然，潜水器的屏幕打开了，出现了一段老电影。那是Ryan的留言吧……
Andrew Ryan：我是Andrew Ryan，我在这向你们问个问题：农夫不能拥有自己辛勤劳动的成果么？不能，华盛顿的人说，那是那是属于穷人的。不能，梵蒂冈的人说，那是属于上帝。不能，莫斯科的人说，那是属于全体得。（游戏里面也不忘说一下社会主义好，哈哈）我驳回了那些回答。我选择了其他的答案。我选择了不可能的，我选择…..Rapture。那里艺术将不再惧怕检查官，那里科学家将不在受到道德的束缚，那里伟大的将不再受到藐小的束缚。在你们辛勤劳作下，Rapure也将变成你们自己的城市。
看完小电影后，一路看看海底风景，接着可以听到无线电里面传来人们的对话。
Altas：….不过那灯塔就象地狱火一样的亮啊…..看起来像是有飞机坠毁了….
Johnny：….我们可是在中大西洋啊….那怎么可能…
Altas：我怎么知道啊，你最好赶到那去，而且要快点…那些‘疯子’（暂时就先这么称呼他们）马上就要到了…
Johnny：你真会开玩笑－你怎么知道有人要来了？
Altas：因为有个潜水器正在下来….那就是说我们有同伴了。
第一幕：欢迎来到Rapture
游戏开始后继续听到那两傻子的对话….
Johnny：好的，马上过去….这个潜水器…..….马上就要来了…
Altas：Johnny，安全系统突然都…….快点吧！
接着听到一个男人颤抖的声音….
Johnny：请别这样，女士…我不是故意闯进来地。请别伤害我…
Johnny：：放过我吧…..你可以拿我的枪..你可以…啊…..
主角在一个神奇的水下世界目睹了一个员工被神奇的杀害了…..
怪人（女性）：你是新来的？
接着就是些奇怪的声音，那家伙貌似离开了，那个员工铁定是死无全尸了…
忽然耳边想起了无线电的声音，是刚才聊天的家伙
Atlas：请你拿起那边的短波无线电，好吗？快点，那个女变态还在附近呢….
没办法，主角只能按他说的作，拿起潜水器壁上的无线电（按E键），之后听到那家伙的声音。
Altas：我不知道你是如何从那飞机失事当中活下来的，也不想过问。我叫Atlas，我现在要帮你活下来。现在继续走……我们要帮你设法到达上层。深呼吸然后走出那个潜水器，我不会留下你孤军奋战的。我们要把她找出来，不过首先你得信任我才行。
走出潜水器，此时地任务目标是到达上层。一路前进在一拐弯处看到一个自动防卫系统干掉了一个疯子，接着听到Atlas开心地大叫。
Atlas：再来一些……你感觉怎么样啊，妹妹？
之后在附近溜达一下，听到Atlas地提示。
Atlas：现在你可以找一个撬棍之类地东西了吧？那些嗜血地疯子杀了Johnny…….该死的‘疯子’。
在附近的一个箱子旁边可以找到一个大扳手，现在可以用它作武器了。接着用扳手砸开箱子前面的碎石，从砸开的入口进去。躲开楼上疯子推下来的着火的柜子，上楼梯干掉这个白痴然后到二楼拿到电击技能的针剂，此时将看到主角双手出现电流的模样….
Atlas：现在要稳住！你的遗传代码正在被重组－坚持住，一切都会好起来的！
之后的主角貌似失去控制，从二楼重重的摔了下来…..眼前朦胧的看到了一些怪人走来走去，耳边还有声音….
怪人1：这家伙似乎是第一次用啊…..只是想搞清楚他是不是得到了Adam（何物？）？
怪人2：你听到了么？我们快走吧..
怪人1：你这软弱的家伙！
女声：胆小鬼！你总是这样！你和金属机器人待一起是没有好下场的，小家伙，你死定了…
接着听到个小女孩的声音还有重金属走路的声音…..
小女孩：看Bubbles先生，这是个天使－我能看到他的腹部发出光线…..等一下，他还活着。没关系，我知道他很快就会成为天使的。
…….过了一会，主角摇摇晃晃的站了起来，耳边响起Atlas的声音。
Atlas：你没事吧？第一次的感觉就像被骡子踢了一样。不过……现在没有什么能比释放闪电还爽的了，不是吗？
站起来后切换到电击模式，对准正门旁边的开关来一下就可以打开这扇大门。进入通道后不久，通道破裂，不理他从通道一边绕过去继续前进，干掉路上碰到的白痴后从打开的门上楼梯，听到有人自言自语，接着干掉从天而降的火人。进门，坐电梯上楼，此时听到Atlas的声音。
Atlas：听着－我已经成家了。我要把他们从这儿救出去。但是那些疯子把我们隔开了－如果你能在Neptune’s Bounty和他们取得联系的话，那么也许，只是也许…我了解你肯定觉得现在自己是世上最不幸的人，但是你是我和妻儿再次重逢的唯一希望了。赶到Neptune’s Bounty…….找到我的家人…..求你了。
