如果当初没有得到解码器 就不能进入C-Consciousness所在的房间 而是要面对许愿石 据说有五个结局
如果纪律团和自由团的头子都被玩家干掉了 那么史小强来到许愿石前许下的愿望是称霸这个世界 于是许愿石吸收了史小强的肉身 只留下地上一堆衣服
如果到许愿石的时候 玩家身上有很多钱 那么史小强许的愿望是成为大富翁 于是史小强眼前出现幻觉 漫天下金雨了 其实是房子塌了 把史小强埋在了一堆瓦砾中
如果史小强一路上恶名卓著 那么来到许愿石前 史小强认为人类已经堕落 必须受到约束 结果幻觉中他看到了世界末日 但是醒来时却已坠入黑暗世界
如果史小强与各派都和睦相处 那么来到许愿石前他许下愿望是THE ZONE消失 结果幻觉中切尔诺贝利回到了正常的生活中 但是其实这都是幻觉 真是的情况是史小强变成了瞎子 切尔诺贝利是消失不见了 ！但只是对他一个人而言
如果以上条件都未达到 史小强来到许愿石前 许下的愿望是永垂不朽 于是史小强变成了一尊铜像矗立在许愿石前 他做到了
至于说晴空
晴空的主角变成了刀疤脸 一个和大多数潜行者一样靠变异区混饭吃的佣兵 一次 他带一队科学家深入到变异区进行科学研究途中 遭遇一场辐射风暴 一般人必死无疑的情况下 他却侥幸活了下来 并被发现他的晴空组织救起 这个晴空组织是原版没有的 晴空里才有的一个神秘组织 据它的领导者Lebedev介绍说该组织的宗旨就是要接触调查研究变异区以使得人类能够知己知彼 对于刀疤脸能在辐射风暴中存活下来 Lebedev也感到很惊异 他猜想也许是刀疤脸的奇异体质和变异区能够共存 但是这种平衡和和谐的局面似乎正遭到破坏 因为最近变异区的辐射风暴越来越厉害 越来越没有规律 而这一现象的加剧都在威胁着包括刀疤脸在内的所有生活在变异区内的潜行者 而这一切似乎都是因一个叫做史特莱洛克的潜行者和他的小队而起 似乎是因为他们的行动使得变异区的核心地带做出的自卫反应 于是刀疤脸为了自己也为了全体潜行者 踏上了前往变异区的核心 石棺和杀死史特莱洛克之路
按照晴空的最终剧情 主角和晴空组织一方与史特莱洛克与黑石为另一方的恶战 最后虽然干掉了史特莱洛克 其实他没死 而是被洗脑并利用 去执行杀死史特莱洛克的任务了（接原版） 至于晴空的主角刀疤脸和晴空组织哪里去了 估计是在杀死史特莱洛克之后遭遇的风暴里全挂了 或者是被改造加入黑石组织了
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