出现在昴眼前的，是露娜使用着的Wizard！她告诉昴一行人，露娜成为了电波体在狮子岛的网络内分散着。虽然露娜并没有死，但是要恢复露娜的原样似乎也是成了一件不可能的事情。为了能够顺利找回露娜的电波信息，博士决定让晓的Wizard：Acid前往辅助昴，回到狮子岛处。分别按照图中位置探索，并到狮子城强行夺回资料。
另外一方面，在WAXA总部，美空他们似乎遭遇到了非常多复制的WarRock的袭击。极端需要昴的辅助，获得宇宙通行证2后，昴马上前往宇宙网络。
返回日本宇宙网络1区，噪音的影响越来越严重了。这时候，上一代的敌人黑暗幻影Phantom Black再次出现了，随着噪音的影响，洛克人变身了。赶跑了黑暗幻影后，现在优先事件是去WAXA那里，使用刚获得的开门芯片赶往WAXA日本支部。
守卫WAXA小游戏：操作WarRock，按B进行攻击，将前来冒犯的假WarRock全部消灭即可，但是注意身后的防御槽的血量。直接碰到对方则会是进入战斗。
防御战分为4个阶段，而第二阶段这下要守卫两边，稍微有点麻烦了，第三阶段则虽然单守一个门，不过敌人速度会变得更快。第四阶段也相对比较容易一些。